Protein–RNA interactions for Protein: P0DMR3

ATXN8OS, Putative protein ATXN8OS, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN8OSP0DMR3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATXN8OSP0DMR3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATXN8OSP0DMR3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATXN8OSP0DMR3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ATXN8OSP0DMR3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATXN8OSP0DMR3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATXN8OSP0DMR3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATXN8OSP0DMR3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATXN8OSP0DMR3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATXN8OSP0DMR3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATXN8OSP0DMR3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATXN8OSP0DMR3 AL158211.2-201ENST00000607282 395 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ATXN8OSP0DMR3 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ATXN8OSP0DMR3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATXN8OSP0DMR3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ATXN8OSP0DMR3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATXN8OSP0DMR3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATXN8OSP0DMR3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATXN8OSP0DMR3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATXN8OSP0DMR3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATXN8OSP0DMR3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATXN8OSP0DMR3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATXN8OSP0DMR3 KLRF1-201ENST00000279545 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATXN8OSP0DMR3 KLRF1-208ENST00000617889 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATXN8OSP0DMR3 AC137936.2-202ENST00000638124 1146 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATXN8OSP0DMR3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATXN8OSP0DMR3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ATXN8OSP0DMR3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATXN8OSP0DMR3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATXN8OSP0DMR3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATXN8OSP0DMR3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATXN8OSP0DMR3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATXN8OSP0DMR3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATXN8OSP0DMR3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATXN8OSP0DMR3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATXN8OSP0DMR3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATXN8OSP0DMR3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATXN8OSP0DMR3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATXN8OSP0DMR3 AL603841.1-201ENST00000430516 664 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ATXN8OSP0DMR3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ATXN8OSP0DMR3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATXN8OSP0DMR3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATXN8OSP0DMR3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATXN8OSP0DMR3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATXN8OSP0DMR3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATXN8OSP0DMR3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ATXN8OSP0DMR3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATXN8OSP0DMR3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATXN8OSP0DMR3 AL109935.1-201ENST00000413249 473 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATXN8OSP0DMR3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATXN8OSP0DMR3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATXN8OSP0DMR3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATXN8OSP0DMR3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATXN8OSP0DMR3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATXN8OSP0DMR3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATXN8OSP0DMR3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATXN8OSP0DMR3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATXN8OSP0DMR3 IFNA1-201ENST00000276927 863 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATXN8OSP0DMR3 AC108718.1-201ENST00000482382 554 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATXN8OSP0DMR3 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ATXN8OSP0DMR3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATXN8OSP0DMR3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ATXN8OSP0DMR3 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATXN8OSP0DMR3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATXN8OSP0DMR3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATXN8OSP0DMR3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATXN8OSP0DMR3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATXN8OSP0DMR3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATXN8OSP0DMR3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATXN8OSP0DMR3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ATXN8OSP0DMR3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATXN8OSP0DMR3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATXN8OSP0DMR3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATXN8OSP0DMR3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATXN8OSP0DMR3 AP002336.2-201ENST00000528607 539 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATXN8OSP0DMR3 AL136370.1-201ENST00000608166 691 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ATXN8OSP0DMR3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATXN8OSP0DMR3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATXN8OSP0DMR3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ATXN8OSP0DMR3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATXN8OSP0DMR3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATXN8OSP0DMR3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATXN8OSP0DMR3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATXN8OSP0DMR3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATXN8OSP0DMR3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATXN8OSP0DMR3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATXN8OSP0DMR3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATXN8OSP0DMR3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATXN8OSP0DMR3 GMDS-AS1-212ENST00000534160 720 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATXN8OSP0DMR3 AC019209.2-201ENST00000545704 373 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATXN8OSP0DMR3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ATXN8OSP0DMR3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATXN8OSP0DMR3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATXN8OSP0DMR3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATXN8OSP0DMR3 LINC00972-202ENST00000438065 788 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATXN8OSP0DMR3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATXN8OSP0DMR3 CBR3-AS1-213ENST00000623647 815 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATXN8OSP0DMR3 ENKUR-202ENST00000376363 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATXN8OSP0DMR3 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATXN8OSP0DMR3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms