Protein–RNA interactions for Protein: P0CJ79

ZNF888, Zinc finger protein 888, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF888P0CJ79 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF888P0CJ79 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF888P0CJ79 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF888P0CJ79 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF888P0CJ79 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF888P0CJ79 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF888P0CJ79 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF888P0CJ79 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF888P0CJ79 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF888P0CJ79 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF888P0CJ79 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF888P0CJ79 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF888P0CJ79 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF888P0CJ79 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF888P0CJ79 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF888P0CJ79 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF888P0CJ79 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF888P0CJ79 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF888P0CJ79 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF888P0CJ79 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF888P0CJ79 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF888P0CJ79 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF888P0CJ79 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF888P0CJ79 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF888P0CJ79 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF888P0CJ79 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF888P0CJ79 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF888P0CJ79 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF888P0CJ79 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF888P0CJ79 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF888P0CJ79 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF888P0CJ79 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF888P0CJ79 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF888P0CJ79 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF888P0CJ79 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF888P0CJ79 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF888P0CJ79 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF888P0CJ79 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF888P0CJ79 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF888P0CJ79 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF888P0CJ79 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF888P0CJ79 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF888P0CJ79 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF888P0CJ79 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF888P0CJ79 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF888P0CJ79 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF888P0CJ79 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF888P0CJ79 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF888P0CJ79 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF888P0CJ79 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF888P0CJ79 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF888P0CJ79 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF888P0CJ79 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF888P0CJ79 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF888P0CJ79 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF888P0CJ79 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF888P0CJ79 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF888P0CJ79 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF888P0CJ79 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF888P0CJ79 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF888P0CJ79 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF888P0CJ79 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF888P0CJ79 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF888P0CJ79 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF888P0CJ79 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF888P0CJ79 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF888P0CJ79 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF888P0CJ79 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF888P0CJ79 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF888P0CJ79 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF888P0CJ79 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF888P0CJ79 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF888P0CJ79 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF888P0CJ79 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF888P0CJ79 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF888P0CJ79 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF888P0CJ79 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF888P0CJ79 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF888P0CJ79 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF888P0CJ79 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF888P0CJ79 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF888P0CJ79 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF888P0CJ79 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF888P0CJ79 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF888P0CJ79 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF888P0CJ79 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF888P0CJ79 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF888P0CJ79 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF888P0CJ79 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF888P0CJ79 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF888P0CJ79 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF888P0CJ79 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF888P0CJ79 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF888P0CJ79 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF888P0CJ79 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF888P0CJ79 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF888P0CJ79 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF888P0CJ79 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF888P0CJ79 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF888P0CJ79 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98 ms