Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GJB1P08034 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GJB1P08034 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GJB1P08034 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GJB1P08034 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GJB1P08034 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
GJB1P08034 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GJB1P08034 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GJB1P08034 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GJB1P08034 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27■■□□□ 1.91
GJB1P08034 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
GJB1P08034 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
GJB1P08034 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GJB1P08034 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GJB1P08034 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GJB1P08034 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GJB1P08034 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GJB1P08034 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GJB1P08034 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GJB1P08034 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GJB1P08034 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GJB1P08034 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GJB1P08034 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GJB1P08034 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GJB1P08034 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GJB1P08034 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GJB1P08034 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GJB1P08034 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GJB1P08034 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GJB1P08034 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GJB1P08034 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GJB1P08034 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GJB1P08034 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GJB1P08034 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GJB1P08034 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GJB1P08034 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GJB1P08034 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GJB1P08034 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GJB1P08034 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GJB1P08034 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GJB1P08034 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GJB1P08034 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GJB1P08034 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GJB1P08034 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GJB1P08034 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GJB1P08034 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GJB1P08034 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GJB1P08034 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GJB1P08034 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GJB1P08034 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GJB1P08034 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GJB1P08034 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GJB1P08034 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GJB1P08034 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GJB1P08034 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GJB1P08034 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GJB1P08034 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GJB1P08034 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GJB1P08034 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GJB1P08034 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
GJB1P08034 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GJB1P08034 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GJB1P08034 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GJB1P08034 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GJB1P08034 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GJB1P08034 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GJB1P08034 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GJB1P08034 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GJB1P08034 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GJB1P08034 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GJB1P08034 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GJB1P08034 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GJB1P08034 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GJB1P08034 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GJB1P08034 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GJB1P08034 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GJB1P08034 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GJB1P08034 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GJB1P08034 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
GJB1P08034 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
GJB1P08034 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
GJB1P08034 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
GJB1P08034 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GJB1P08034 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GJB1P08034 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GJB1P08034 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
GJB1P08034 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GJB1P08034 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GJB1P08034 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GJB1P08034 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
GJB1P08034 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
GJB1P08034 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GJB1P08034 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GJB1P08034 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
GJB1P08034 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GJB1P08034 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GJB1P08034 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GJB1P08034 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
GJB1P08034 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GJB1P08034 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms