Protein–RNA interactions for Protein: P02545

LMNA, Prelamin-A/C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNAP02545 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LMNAP02545 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMNAP02545 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMNAP02545 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMNAP02545 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
LMNAP02545 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
LMNAP02545 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMNAP02545 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMNAP02545 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMNAP02545 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMNAP02545 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
LMNAP02545 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LMNAP02545 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMNAP02545 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMNAP02545 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LMNAP02545 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMNAP02545 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LMNAP02545 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
LMNAP02545 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LMNAP02545 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMNAP02545 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LMNAP02545 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMNAP02545 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMNAP02545 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMNAP02545 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LMNAP02545 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMNAP02545 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMNAP02545 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMNAP02545 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMNAP02545 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMNAP02545 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMNAP02545 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMNAP02545 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LMNAP02545 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMNAP02545 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMNAP02545 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LMNAP02545 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMNAP02545 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMNAP02545 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMNAP02545 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMNAP02545 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMNAP02545 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LMNAP02545 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMNAP02545 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMNAP02545 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMNAP02545 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMNAP02545 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMNAP02545 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMNAP02545 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LMNAP02545 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMNAP02545 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMNAP02545 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMNAP02545 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LMNAP02545 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMNAP02545 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMNAP02545 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMNAP02545 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMNAP02545 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LMNAP02545 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LMNAP02545 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
LMNAP02545 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LMNAP02545 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
LMNAP02545 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
LMNAP02545 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LMNAP02545 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LMNAP02545 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LMNAP02545 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMNAP02545 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMNAP02545 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMNAP02545 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMNAP02545 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMNAP02545 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LMNAP02545 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMNAP02545 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMNAP02545 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMNAP02545 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LMNAP02545 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMNAP02545 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMNAP02545 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMNAP02545 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMNAP02545 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMNAP02545 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMNAP02545 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMNAP02545 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMNAP02545 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMNAP02545 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMNAP02545 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMNAP02545 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LMNAP02545 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMNAP02545 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMNAP02545 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMNAP02545 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMNAP02545 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LMNAP02545 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LMNAP02545 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMNAP02545 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMNAP02545 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMNAP02545 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMNAP02545 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LMNAP02545 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms