Protein–RNA interactions for Protein: O95873

C6orf47, Uncharacterized protein C6orf47, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf47O95873 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C6orf47O95873 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C6orf47O95873 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C6orf47O95873 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C6orf47O95873 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C6orf47O95873 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C6orf47O95873 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C6orf47O95873 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C6orf47O95873 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C6orf47O95873 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C6orf47O95873 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C6orf47O95873 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C6orf47O95873 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C6orf47O95873 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C6orf47O95873 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
C6orf47O95873 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C6orf47O95873 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C6orf47O95873 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C6orf47O95873 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C6orf47O95873 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C6orf47O95873 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C6orf47O95873 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C6orf47O95873 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C6orf47O95873 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C6orf47O95873 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C6orf47O95873 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
C6orf47O95873 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C6orf47O95873 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C6orf47O95873 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C6orf47O95873 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C6orf47O95873 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C6orf47O95873 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C6orf47O95873 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C6orf47O95873 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C6orf47O95873 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C6orf47O95873 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C6orf47O95873 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C6orf47O95873 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
C6orf47O95873 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C6orf47O95873 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C6orf47O95873 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C6orf47O95873 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C6orf47O95873 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C6orf47O95873 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C6orf47O95873 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C6orf47O95873 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C6orf47O95873 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C6orf47O95873 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C6orf47O95873 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C6orf47O95873 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C6orf47O95873 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C6orf47O95873 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C6orf47O95873 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C6orf47O95873 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C6orf47O95873 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C6orf47O95873 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C6orf47O95873 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C6orf47O95873 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C6orf47O95873 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
C6orf47O95873 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C6orf47O95873 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C6orf47O95873 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C6orf47O95873 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C6orf47O95873 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C6orf47O95873 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C6orf47O95873 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C6orf47O95873 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C6orf47O95873 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C6orf47O95873 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C6orf47O95873 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C6orf47O95873 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C6orf47O95873 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C6orf47O95873 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C6orf47O95873 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C6orf47O95873 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C6orf47O95873 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
C6orf47O95873 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
C6orf47O95873 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C6orf47O95873 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C6orf47O95873 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C6orf47O95873 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C6orf47O95873 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C6orf47O95873 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C6orf47O95873 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C6orf47O95873 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C6orf47O95873 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C6orf47O95873 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C6orf47O95873 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C6orf47O95873 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C6orf47O95873 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C6orf47O95873 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C6orf47O95873 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C6orf47O95873 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
C6orf47O95873 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C6orf47O95873 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C6orf47O95873 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C6orf47O95873 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
C6orf47O95873 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C6orf47O95873 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C6orf47O95873 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms