Protein–RNA interactions for Protein: O60238

BNIP3L, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3-like, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3LO60238 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BNIP3LO60238 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
BNIP3LO60238 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BNIP3LO60238 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BNIP3LO60238 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
BNIP3LO60238 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
BNIP3LO60238 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BNIP3LO60238 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BNIP3LO60238 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BNIP3LO60238 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BNIP3LO60238 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BNIP3LO60238 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
BNIP3LO60238 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BNIP3LO60238 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BNIP3LO60238 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BNIP3LO60238 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BNIP3LO60238 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BNIP3LO60238 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BNIP3LO60238 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BNIP3LO60238 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
BNIP3LO60238 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BNIP3LO60238 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
BNIP3LO60238 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BNIP3LO60238 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BNIP3LO60238 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
BNIP3LO60238 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BNIP3LO60238 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
BNIP3LO60238 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BNIP3LO60238 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BNIP3LO60238 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BNIP3LO60238 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BNIP3LO60238 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
BNIP3LO60238 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
BNIP3LO60238 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BNIP3LO60238 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BNIP3LO60238 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BNIP3LO60238 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BNIP3LO60238 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BNIP3LO60238 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BNIP3LO60238 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BNIP3LO60238 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BNIP3LO60238 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BNIP3LO60238 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BNIP3LO60238 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BNIP3LO60238 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BNIP3LO60238 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BNIP3LO60238 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BNIP3LO60238 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BNIP3LO60238 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BNIP3LO60238 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
BNIP3LO60238 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BNIP3LO60238 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
BNIP3LO60238 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BNIP3LO60238 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BNIP3LO60238 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BNIP3LO60238 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BNIP3LO60238 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BNIP3LO60238 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BNIP3LO60238 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BNIP3LO60238 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BNIP3LO60238 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BNIP3LO60238 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BNIP3LO60238 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BNIP3LO60238 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BNIP3LO60238 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BNIP3LO60238 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BNIP3LO60238 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BNIP3LO60238 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BNIP3LO60238 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
BNIP3LO60238 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BNIP3LO60238 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BNIP3LO60238 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BNIP3LO60238 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BNIP3LO60238 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BNIP3LO60238 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
BNIP3LO60238 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BNIP3LO60238 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BNIP3LO60238 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BNIP3LO60238 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BNIP3LO60238 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BNIP3LO60238 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
BNIP3LO60238 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BNIP3LO60238 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BNIP3LO60238 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BNIP3LO60238 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BNIP3LO60238 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BNIP3LO60238 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BNIP3LO60238 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BNIP3LO60238 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BNIP3LO60238 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BNIP3LO60238 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BNIP3LO60238 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
BNIP3LO60238 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BNIP3LO60238 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BNIP3LO60238 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
BNIP3LO60238 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BNIP3LO60238 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
BNIP3LO60238 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
BNIP3LO60238 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BNIP3LO60238 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.8 ms