Protein–RNA interactions for Protein: O43402

EMC8, ER membrane protein complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMC8O43402 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
EMC8O43402 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EMC8O43402 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EMC8O43402 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EMC8O43402 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EMC8O43402 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
EMC8O43402 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EMC8O43402 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
EMC8O43402 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EMC8O43402 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EMC8O43402 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EMC8O43402 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EMC8O43402 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EMC8O43402 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EMC8O43402 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EMC8O43402 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EMC8O43402 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EMC8O43402 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EMC8O43402 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EMC8O43402 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EMC8O43402 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EMC8O43402 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EMC8O43402 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
EMC8O43402 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EMC8O43402 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EMC8O43402 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EMC8O43402 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EMC8O43402 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EMC8O43402 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
EMC8O43402 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EMC8O43402 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EMC8O43402 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EMC8O43402 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EMC8O43402 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EMC8O43402 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EMC8O43402 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
EMC8O43402 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
EMC8O43402 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
EMC8O43402 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EMC8O43402 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EMC8O43402 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EMC8O43402 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EMC8O43402 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EMC8O43402 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EMC8O43402 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EMC8O43402 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EMC8O43402 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EMC8O43402 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EMC8O43402 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EMC8O43402 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EMC8O43402 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EMC8O43402 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EMC8O43402 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
EMC8O43402 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EMC8O43402 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EMC8O43402 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EMC8O43402 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EMC8O43402 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EMC8O43402 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EMC8O43402 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EMC8O43402 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EMC8O43402 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EMC8O43402 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EMC8O43402 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
EMC8O43402 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EMC8O43402 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EMC8O43402 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EMC8O43402 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EMC8O43402 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EMC8O43402 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
EMC8O43402 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
EMC8O43402 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EMC8O43402 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EMC8O43402 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EMC8O43402 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EMC8O43402 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EMC8O43402 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EMC8O43402 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EMC8O43402 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EMC8O43402 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
EMC8O43402 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EMC8O43402 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EMC8O43402 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EMC8O43402 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EMC8O43402 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EMC8O43402 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EMC8O43402 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
EMC8O43402 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EMC8O43402 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
EMC8O43402 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EMC8O43402 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EMC8O43402 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EMC8O43402 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EMC8O43402 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EMC8O43402 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EMC8O43402 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EMC8O43402 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EMC8O43402 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EMC8O43402 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EMC8O43402 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms