Protein–RNA interactions for Protein: O14975

SLC27A2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A2O14975 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC27A2O14975 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SLC27A2O14975 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SLC27A2O14975 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SLC27A2O14975 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC27A2O14975 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC27A2O14975 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC27A2O14975 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SLC27A2O14975 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC27A2O14975 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC27A2O14975 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC27A2O14975 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC27A2O14975 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC27A2O14975 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SLC27A2O14975 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC27A2O14975 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC27A2O14975 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC27A2O14975 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC27A2O14975 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC27A2O14975 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC27A2O14975 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC27A2O14975 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC27A2O14975 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC27A2O14975 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC27A2O14975 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC27A2O14975 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC27A2O14975 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC27A2O14975 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC27A2O14975 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC27A2O14975 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC27A2O14975 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC27A2O14975 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC27A2O14975 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC27A2O14975 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC27A2O14975 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC27A2O14975 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC27A2O14975 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC27A2O14975 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC27A2O14975 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC27A2O14975 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC27A2O14975 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC27A2O14975 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
SLC27A2O14975 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC27A2O14975 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC27A2O14975 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC27A2O14975 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC27A2O14975 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC27A2O14975 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC27A2O14975 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC27A2O14975 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC27A2O14975 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC27A2O14975 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC27A2O14975 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC27A2O14975 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC27A2O14975 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC27A2O14975 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC27A2O14975 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC27A2O14975 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC27A2O14975 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC27A2O14975 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC27A2O14975 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC27A2O14975 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC27A2O14975 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC27A2O14975 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC27A2O14975 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC27A2O14975 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC27A2O14975 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC27A2O14975 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC27A2O14975 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC27A2O14975 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC27A2O14975 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC27A2O14975 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC27A2O14975 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC27A2O14975 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC27A2O14975 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC27A2O14975 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC27A2O14975 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC27A2O14975 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC27A2O14975 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC27A2O14975 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC27A2O14975 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC27A2O14975 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC27A2O14975 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC27A2O14975 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC27A2O14975 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC27A2O14975 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC27A2O14975 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC27A2O14975 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC27A2O14975 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC27A2O14975 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC27A2O14975 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC27A2O14975 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC27A2O14975 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC27A2O14975 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SLC27A2O14975 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SLC27A2O14975 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SLC27A2O14975 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SLC27A2O14975 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SLC27A2O14975 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SLC27A2O14975 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms