Protein–RNA interactions for Protein: O14879

IFIT3, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIT3O14879 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
IFIT3O14879 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
IFIT3O14879 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
IFIT3O14879 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
IFIT3O14879 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
IFIT3O14879 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
IFIT3O14879 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
IFIT3O14879 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
IFIT3O14879 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
IFIT3O14879 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
IFIT3O14879 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
IFIT3O14879 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
IFIT3O14879 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
IFIT3O14879 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
IFIT3O14879 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
IFIT3O14879 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
IFIT3O14879 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
IFIT3O14879 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
IFIT3O14879 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
IFIT3O14879 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
IFIT3O14879 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
IFIT3O14879 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
IFIT3O14879 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
IFIT3O14879 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
IFIT3O14879 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
IFIT3O14879 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
IFIT3O14879 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
IFIT3O14879 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
IFIT3O14879 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
IFIT3O14879 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
IFIT3O14879 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
IFIT3O14879 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
IFIT3O14879 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
IFIT3O14879 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
IFIT3O14879 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
IFIT3O14879 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
IFIT3O14879 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
IFIT3O14879 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
IFIT3O14879 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
IFIT3O14879 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
IFIT3O14879 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
IFIT3O14879 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
IFIT3O14879 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
IFIT3O14879 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
IFIT3O14879 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
IFIT3O14879 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
IFIT3O14879 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
IFIT3O14879 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
IFIT3O14879 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
IFIT3O14879 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
IFIT3O14879 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
IFIT3O14879 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
IFIT3O14879 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
IFIT3O14879 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
IFIT3O14879 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
IFIT3O14879 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
IFIT3O14879 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
IFIT3O14879 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
IFIT3O14879 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
IFIT3O14879 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
IFIT3O14879 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
IFIT3O14879 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
IFIT3O14879 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
IFIT3O14879 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
IFIT3O14879 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
IFIT3O14879 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
IFIT3O14879 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
IFIT3O14879 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
IFIT3O14879 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
IFIT3O14879 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
IFIT3O14879 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
IFIT3O14879 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
IFIT3O14879 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
IFIT3O14879 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
IFIT3O14879 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
IFIT3O14879 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
IFIT3O14879 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
IFIT3O14879 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
IFIT3O14879 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
IFIT3O14879 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
IFIT3O14879 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
IFIT3O14879 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
IFIT3O14879 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
IFIT3O14879 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
IFIT3O14879 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
IFIT3O14879 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
IFIT3O14879 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
IFIT3O14879 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
IFIT3O14879 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
IFIT3O14879 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
IFIT3O14879 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
IFIT3O14879 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
IFIT3O14879 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
IFIT3O14879 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
IFIT3O14879 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
IFIT3O14879 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
IFIT3O14879 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
IFIT3O14879 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
IFIT3O14879 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
IFIT3O14879 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 906.6 ms