Protein–RNA interactions for Protein: E9PQ18

Putative short transient receptor potential channel 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PQ18 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
E9PQ18 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
E9PQ18 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
E9PQ18 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
E9PQ18 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
E9PQ18 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
E9PQ18 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
E9PQ18 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
E9PQ18 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
E9PQ18 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
E9PQ18 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
E9PQ18 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
E9PQ18 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
E9PQ18 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
E9PQ18 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
E9PQ18 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
E9PQ18 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
E9PQ18 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
E9PQ18 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
E9PQ18 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
E9PQ18 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
E9PQ18 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
E9PQ18 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
E9PQ18 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
E9PQ18 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
E9PQ18 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
E9PQ18 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
E9PQ18 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
E9PQ18 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
E9PQ18 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
E9PQ18 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
E9PQ18 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
E9PQ18 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
E9PQ18 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
E9PQ18 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
E9PQ18 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
E9PQ18 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
E9PQ18 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
E9PQ18 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
E9PQ18 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
E9PQ18 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
E9PQ18 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
E9PQ18 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
E9PQ18 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
E9PQ18 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
E9PQ18 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
E9PQ18 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
E9PQ18 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
E9PQ18 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
E9PQ18 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
E9PQ18 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
E9PQ18 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
E9PQ18 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
E9PQ18 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
E9PQ18 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
E9PQ18 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
E9PQ18 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
E9PQ18 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
E9PQ18 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
E9PQ18 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
E9PQ18 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
E9PQ18 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
E9PQ18 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
E9PQ18 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
E9PQ18 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
E9PQ18 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
E9PQ18 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
E9PQ18 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
E9PQ18 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
E9PQ18 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
E9PQ18 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
E9PQ18 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
E9PQ18 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
E9PQ18 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
E9PQ18 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
E9PQ18 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
E9PQ18 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
E9PQ18 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
E9PQ18 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
E9PQ18 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
E9PQ18 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
E9PQ18 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
E9PQ18 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
E9PQ18 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
E9PQ18 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
E9PQ18 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
E9PQ18 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
E9PQ18 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
E9PQ18 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
E9PQ18 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
E9PQ18 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
E9PQ18 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.33■■□□□ 1
E9PQ18 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
E9PQ18 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
E9PQ18 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
E9PQ18 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
E9PQ18 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
E9PQ18 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
E9PQ18 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
E9PQ18 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms