Protein–RNA interactions for Protein: C9JLW8

MCRIP1, Mapk-regulated corepressor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCRIP1C9JLW8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MCRIP1C9JLW8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MCRIP1C9JLW8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MCRIP1C9JLW8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MCRIP1C9JLW8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MCRIP1C9JLW8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MCRIP1C9JLW8 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MCRIP1C9JLW8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MCRIP1C9JLW8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MCRIP1C9JLW8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MCRIP1C9JLW8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MCRIP1C9JLW8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MCRIP1C9JLW8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MCRIP1C9JLW8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MCRIP1C9JLW8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MCRIP1C9JLW8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MCRIP1C9JLW8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MCRIP1C9JLW8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MCRIP1C9JLW8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MCRIP1C9JLW8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MCRIP1C9JLW8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MCRIP1C9JLW8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MCRIP1C9JLW8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MCRIP1C9JLW8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MCRIP1C9JLW8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MCRIP1C9JLW8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MCRIP1C9JLW8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MCRIP1C9JLW8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MCRIP1C9JLW8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCRIP1C9JLW8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCRIP1C9JLW8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCRIP1C9JLW8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCRIP1C9JLW8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCRIP1C9JLW8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCRIP1C9JLW8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCRIP1C9JLW8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCRIP1C9JLW8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCRIP1C9JLW8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCRIP1C9JLW8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MCRIP1C9JLW8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCRIP1C9JLW8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCRIP1C9JLW8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCRIP1C9JLW8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCRIP1C9JLW8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCRIP1C9JLW8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCRIP1C9JLW8 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MCRIP1C9JLW8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCRIP1C9JLW8 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCRIP1C9JLW8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
MCRIP1C9JLW8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCRIP1C9JLW8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCRIP1C9JLW8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MCRIP1C9JLW8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCRIP1C9JLW8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCRIP1C9JLW8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCRIP1C9JLW8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCRIP1C9JLW8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCRIP1C9JLW8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCRIP1C9JLW8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCRIP1C9JLW8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCRIP1C9JLW8 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCRIP1C9JLW8 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MCRIP1C9JLW8 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCRIP1C9JLW8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCRIP1C9JLW8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCRIP1C9JLW8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCRIP1C9JLW8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCRIP1C9JLW8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCRIP1C9JLW8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCRIP1C9JLW8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCRIP1C9JLW8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCRIP1C9JLW8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCRIP1C9JLW8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCRIP1C9JLW8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCRIP1C9JLW8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCRIP1C9JLW8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCRIP1C9JLW8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCRIP1C9JLW8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCRIP1C9JLW8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCRIP1C9JLW8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCRIP1C9JLW8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCRIP1C9JLW8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MCRIP1C9JLW8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCRIP1C9JLW8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCRIP1C9JLW8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCRIP1C9JLW8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCRIP1C9JLW8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCRIP1C9JLW8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCRIP1C9JLW8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCRIP1C9JLW8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCRIP1C9JLW8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCRIP1C9JLW8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCRIP1C9JLW8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCRIP1C9JLW8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCRIP1C9JLW8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCRIP1C9JLW8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCRIP1C9JLW8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCRIP1C9JLW8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCRIP1C9JLW8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCRIP1C9JLW8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms