Protein–RNA interactions for Protein: C9J366

IQCJ-SCHIP1, IQCJ-SCHIP1 readthrough, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQCJ-SCHIP1C9J366 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IQCJ-SCHIP1C9J366 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IQCJ-SCHIP1C9J366 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
IQCJ-SCHIP1C9J366 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
IQCJ-SCHIP1C9J366 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IQCJ-SCHIP1C9J366 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IQCJ-SCHIP1C9J366 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IQCJ-SCHIP1C9J366 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
IQCJ-SCHIP1C9J366 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IQCJ-SCHIP1C9J366 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IQCJ-SCHIP1C9J366 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IQCJ-SCHIP1C9J366 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IQCJ-SCHIP1C9J366 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IQCJ-SCHIP1C9J366 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
IQCJ-SCHIP1C9J366 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IQCJ-SCHIP1C9J366 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IQCJ-SCHIP1C9J366 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IQCJ-SCHIP1C9J366 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IQCJ-SCHIP1C9J366 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IQCJ-SCHIP1C9J366 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IQCJ-SCHIP1C9J366 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IQCJ-SCHIP1C9J366 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
IQCJ-SCHIP1C9J366 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IQCJ-SCHIP1C9J366 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IQCJ-SCHIP1C9J366 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
IQCJ-SCHIP1C9J366 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IQCJ-SCHIP1C9J366 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IQCJ-SCHIP1C9J366 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
IQCJ-SCHIP1C9J366 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
IQCJ-SCHIP1C9J366 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IQCJ-SCHIP1C9J366 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IQCJ-SCHIP1C9J366 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IQCJ-SCHIP1C9J366 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IQCJ-SCHIP1C9J366 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IQCJ-SCHIP1C9J366 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IQCJ-SCHIP1C9J366 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
IQCJ-SCHIP1C9J366 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IQCJ-SCHIP1C9J366 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IQCJ-SCHIP1C9J366 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IQCJ-SCHIP1C9J366 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IQCJ-SCHIP1C9J366 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IQCJ-SCHIP1C9J366 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
IQCJ-SCHIP1C9J366 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IQCJ-SCHIP1C9J366 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IQCJ-SCHIP1C9J366 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
IQCJ-SCHIP1C9J366 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IQCJ-SCHIP1C9J366 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IQCJ-SCHIP1C9J366 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms