Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GOLGA6L9A6NEM1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GOLGA6L9A6NEM1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GOLGA6L9A6NEM1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GOLGA6L9A6NEM1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GOLGA6L9A6NEM1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GOLGA6L9A6NEM1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
GOLGA6L9A6NEM1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GOLGA6L9A6NEM1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GOLGA6L9A6NEM1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GOLGA6L9A6NEM1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GOLGA6L9A6NEM1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GOLGA6L9A6NEM1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GOLGA6L9A6NEM1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GOLGA6L9A6NEM1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GOLGA6L9A6NEM1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GOLGA6L9A6NEM1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GOLGA6L9A6NEM1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GOLGA6L9A6NEM1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GOLGA6L9A6NEM1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GOLGA6L9A6NEM1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GOLGA6L9A6NEM1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GOLGA6L9A6NEM1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GOLGA6L9A6NEM1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GOLGA6L9A6NEM1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GOLGA6L9A6NEM1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GOLGA6L9A6NEM1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GOLGA6L9A6NEM1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GOLGA6L9A6NEM1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GOLGA6L9A6NEM1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GOLGA6L9A6NEM1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GOLGA6L9A6NEM1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GOLGA6L9A6NEM1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GOLGA6L9A6NEM1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GOLGA6L9A6NEM1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GOLGA6L9A6NEM1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GOLGA6L9A6NEM1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GOLGA6L9A6NEM1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GOLGA6L9A6NEM1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GOLGA6L9A6NEM1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GOLGA6L9A6NEM1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
GOLGA6L9A6NEM1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
GOLGA6L9A6NEM1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GOLGA6L9A6NEM1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GOLGA6L9A6NEM1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GOLGA6L9A6NEM1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GOLGA6L9A6NEM1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GOLGA6L9A6NEM1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GOLGA6L9A6NEM1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GOLGA6L9A6NEM1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GOLGA6L9A6NEM1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GOLGA6L9A6NEM1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GOLGA6L9A6NEM1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GOLGA6L9A6NEM1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GOLGA6L9A6NEM1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GOLGA6L9A6NEM1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GOLGA6L9A6NEM1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GOLGA6L9A6NEM1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
GOLGA6L9A6NEM1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GOLGA6L9A6NEM1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GOLGA6L9A6NEM1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GOLGA6L9A6NEM1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GOLGA6L9A6NEM1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GOLGA6L9A6NEM1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GOLGA6L9A6NEM1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GOLGA6L9A6NEM1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GOLGA6L9A6NEM1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GOLGA6L9A6NEM1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GOLGA6L9A6NEM1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GOLGA6L9A6NEM1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GOLGA6L9A6NEM1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
GOLGA6L9A6NEM1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GOLGA6L9A6NEM1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GOLGA6L9A6NEM1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GOLGA6L9A6NEM1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GOLGA6L9A6NEM1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GOLGA6L9A6NEM1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GOLGA6L9A6NEM1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GOLGA6L9A6NEM1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GOLGA6L9A6NEM1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GOLGA6L9A6NEM1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GOLGA6L9A6NEM1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GOLGA6L9A6NEM1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GOLGA6L9A6NEM1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GOLGA6L9A6NEM1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GOLGA6L9A6NEM1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GOLGA6L9A6NEM1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GOLGA6L9A6NEM1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GOLGA6L9A6NEM1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GOLGA6L9A6NEM1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GOLGA6L9A6NEM1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GOLGA6L9A6NEM1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GOLGA6L9A6NEM1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GOLGA6L9A6NEM1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GOLGA6L9A6NEM1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GOLGA6L9A6NEM1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GOLGA6L9A6NEM1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms