Protein–RNA interactions for Protein: U3KQE9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQE9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
U3KQE9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
U3KQE9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
U3KQE9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
U3KQE9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
U3KQE9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
U3KQE9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
U3KQE9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
U3KQE9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
U3KQE9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
U3KQE9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
U3KQE9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
U3KQE9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
U3KQE9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
U3KQE9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
U3KQE9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
U3KQE9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
U3KQE9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
U3KQE9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
U3KQE9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
U3KQE9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
U3KQE9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
U3KQE9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
U3KQE9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
U3KQE9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
U3KQE9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
U3KQE9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
U3KQE9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
U3KQE9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
U3KQE9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
U3KQE9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
U3KQE9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
U3KQE9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
U3KQE9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
U3KQE9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
U3KQE9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
U3KQE9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
U3KQE9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
U3KQE9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
U3KQE9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
U3KQE9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
U3KQE9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
U3KQE9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
U3KQE9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
U3KQE9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
U3KQE9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
U3KQE9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
U3KQE9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
U3KQE9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
U3KQE9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
U3KQE9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
U3KQE9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
U3KQE9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
U3KQE9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
U3KQE9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
U3KQE9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
U3KQE9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
U3KQE9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
U3KQE9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
U3KQE9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
U3KQE9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
U3KQE9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
U3KQE9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
U3KQE9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
U3KQE9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
U3KQE9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
U3KQE9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
U3KQE9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
U3KQE9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
U3KQE9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
U3KQE9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
U3KQE9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
U3KQE9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
U3KQE9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
U3KQE9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
U3KQE9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
U3KQE9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
U3KQE9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
U3KQE9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
U3KQE9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
U3KQE9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
U3KQE9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
U3KQE9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
U3KQE9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
U3KQE9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
U3KQE9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
U3KQE9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
U3KQE9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
U3KQE9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
U3KQE9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
U3KQE9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
U3KQE9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
U3KQE9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
U3KQE9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
U3KQE9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
U3KQE9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
U3KQE9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
U3KQE9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
U3KQE9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
U3KQE9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms