Protein–RNA interactions for Protein: U3KQA8

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 63 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQA8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
U3KQA8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
U3KQA8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
U3KQA8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
U3KQA8 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
U3KQA8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
U3KQA8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
U3KQA8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
U3KQA8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
U3KQA8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
U3KQA8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
U3KQA8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
U3KQA8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
U3KQA8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
U3KQA8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
U3KQA8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
U3KQA8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
U3KQA8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
U3KQA8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
U3KQA8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
U3KQA8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
U3KQA8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
U3KQA8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
U3KQA8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
U3KQA8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
U3KQA8 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
U3KQA8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
U3KQA8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
U3KQA8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
U3KQA8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
U3KQA8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
U3KQA8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
U3KQA8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
U3KQA8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
U3KQA8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
U3KQA8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
U3KQA8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
U3KQA8 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
U3KQA8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
U3KQA8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
U3KQA8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
U3KQA8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
U3KQA8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
U3KQA8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
U3KQA8 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
U3KQA8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
U3KQA8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
U3KQA8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
U3KQA8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
U3KQA8 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23■■□□□ 1.27
U3KQA8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
U3KQA8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
U3KQA8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
U3KQA8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
U3KQA8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
U3KQA8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23■■□□□ 1.27
U3KQA8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
U3KQA8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
U3KQA8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
U3KQA8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
U3KQA8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
U3KQA8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
U3KQA8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
U3KQA8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
U3KQA8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
U3KQA8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
U3KQA8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
U3KQA8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
U3KQA8 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
U3KQA8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
U3KQA8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
U3KQA8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
U3KQA8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
U3KQA8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
U3KQA8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
U3KQA8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
U3KQA8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
U3KQA8 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
U3KQA8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
U3KQA8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
U3KQA8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
U3KQA8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
U3KQA8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
U3KQA8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
U3KQA8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
U3KQA8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
U3KQA8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
U3KQA8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
U3KQA8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
U3KQA8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
U3KQA8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
U3KQA8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
U3KQA8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
U3KQA8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
U3KQA8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
U3KQA8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
U3KQA8 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
U3KQA8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
U3KQA8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
U3KQA8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms