Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5R8

TRAPPC1, Trafficking protein particle complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1Q9Y5R8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRAPPC1Q9Y5R8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAPPC1Q9Y5R8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAPPC1Q9Y5R8 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAPPC1Q9Y5R8 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAPPC1Q9Y5R8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAPPC1Q9Y5R8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAPPC1Q9Y5R8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAPPC1Q9Y5R8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAPPC1Q9Y5R8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAPPC1Q9Y5R8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAPPC1Q9Y5R8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAPPC1Q9Y5R8 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAPPC1Q9Y5R8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRAPPC1Q9Y5R8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAPPC1Q9Y5R8 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAPPC1Q9Y5R8 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAPPC1Q9Y5R8 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAPPC1Q9Y5R8 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAPPC1Q9Y5R8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAPPC1Q9Y5R8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRAPPC1Q9Y5R8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC1Q9Y5R8 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC1Q9Y5R8 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC1Q9Y5R8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC1Q9Y5R8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC1Q9Y5R8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC1Q9Y5R8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC1Q9Y5R8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC1Q9Y5R8 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC1Q9Y5R8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC1Q9Y5R8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC1Q9Y5R8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC1Q9Y5R8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRAPPC1Q9Y5R8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC1Q9Y5R8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC1Q9Y5R8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC1Q9Y5R8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC1Q9Y5R8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC1Q9Y5R8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC1Q9Y5R8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC1Q9Y5R8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC1Q9Y5R8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC1Q9Y5R8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC1Q9Y5R8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC1Q9Y5R8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC1Q9Y5R8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC1Q9Y5R8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC1Q9Y5R8 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRAPPC1Q9Y5R8 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC1Q9Y5R8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC1Q9Y5R8 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC1Q9Y5R8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TRAPPC1Q9Y5R8 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms