Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5M8

SRPRB, Signal recognition particle receptor subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRBQ9Y5M8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SRPRBQ9Y5M8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SRPRBQ9Y5M8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SRPRBQ9Y5M8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SRPRBQ9Y5M8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SRPRBQ9Y5M8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SRPRBQ9Y5M8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SRPRBQ9Y5M8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SRPRBQ9Y5M8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SRPRBQ9Y5M8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SRPRBQ9Y5M8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SRPRBQ9Y5M8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SRPRBQ9Y5M8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SRPRBQ9Y5M8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SRPRBQ9Y5M8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SRPRBQ9Y5M8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SRPRBQ9Y5M8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SRPRBQ9Y5M8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SRPRBQ9Y5M8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SRPRBQ9Y5M8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SRPRBQ9Y5M8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SRPRBQ9Y5M8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SRPRBQ9Y5M8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SRPRBQ9Y5M8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SRPRBQ9Y5M8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SRPRBQ9Y5M8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SRPRBQ9Y5M8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SRPRBQ9Y5M8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SRPRBQ9Y5M8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SRPRBQ9Y5M8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SRPRBQ9Y5M8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SRPRBQ9Y5M8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
SRPRBQ9Y5M8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SRPRBQ9Y5M8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SRPRBQ9Y5M8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SRPRBQ9Y5M8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SRPRBQ9Y5M8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SRPRBQ9Y5M8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SRPRBQ9Y5M8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SRPRBQ9Y5M8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SRPRBQ9Y5M8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SRPRBQ9Y5M8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SRPRBQ9Y5M8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SRPRBQ9Y5M8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SRPRBQ9Y5M8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SRPRBQ9Y5M8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SRPRBQ9Y5M8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SRPRBQ9Y5M8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SRPRBQ9Y5M8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SRPRBQ9Y5M8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SRPRBQ9Y5M8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SRPRBQ9Y5M8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SRPRBQ9Y5M8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SRPRBQ9Y5M8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SRPRBQ9Y5M8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SRPRBQ9Y5M8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SRPRBQ9Y5M8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SRPRBQ9Y5M8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
SRPRBQ9Y5M8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
SRPRBQ9Y5M8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SRPRBQ9Y5M8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SRPRBQ9Y5M8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SRPRBQ9Y5M8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SRPRBQ9Y5M8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SRPRBQ9Y5M8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SRPRBQ9Y5M8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SRPRBQ9Y5M8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SRPRBQ9Y5M8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SRPRBQ9Y5M8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SRPRBQ9Y5M8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SRPRBQ9Y5M8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SRPRBQ9Y5M8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SRPRBQ9Y5M8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SRPRBQ9Y5M8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SRPRBQ9Y5M8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SRPRBQ9Y5M8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SRPRBQ9Y5M8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SRPRBQ9Y5M8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SRPRBQ9Y5M8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SRPRBQ9Y5M8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SRPRBQ9Y5M8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SRPRBQ9Y5M8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SRPRBQ9Y5M8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SRPRBQ9Y5M8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SRPRBQ9Y5M8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SRPRBQ9Y5M8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SRPRBQ9Y5M8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SRPRBQ9Y5M8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SRPRBQ9Y5M8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SRPRBQ9Y5M8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SRPRBQ9Y5M8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SRPRBQ9Y5M8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SRPRBQ9Y5M8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SRPRBQ9Y5M8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SRPRBQ9Y5M8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
SRPRBQ9Y5M8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
SRPRBQ9Y5M8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
SRPRBQ9Y5M8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
SRPRBQ9Y5M8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SRPRBQ9Y5M8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms