Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B4

RAD54L2, Helicase ARIP4, humanhuman

Predictions only

Length 1,467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54L2Q9Y4B4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC40.3■■■■■ 4.04
RAD54L2Q9Y4B4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC40.29■■■■■ 4.04
RAD54L2Q9Y4B4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.29■■■■■ 4.04
RAD54L2Q9Y4B4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC40.29■■■■■ 4.04
RAD54L2Q9Y4B4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC40.29■■■■■ 4.04
RAD54L2Q9Y4B4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC40.29■■■■■ 4.04
RAD54L2Q9Y4B4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC40.29■■■■■ 4.04
RAD54L2Q9Y4B4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC40.28■■■■■ 4.04
RAD54L2Q9Y4B4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
RAD54L2Q9Y4B4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC40.27■■■■■ 4.04
RAD54L2Q9Y4B4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC40.27■■■■■ 4.04
RAD54L2Q9Y4B4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.27■■■■■ 4.04
RAD54L2Q9Y4B4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
RAD54L2Q9Y4B4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.27■■■■■ 4.04
RAD54L2Q9Y4B4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
RAD54L2Q9Y4B4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
RAD54L2Q9Y4B4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
RAD54L2Q9Y4B4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.03
RAD54L2Q9Y4B4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC40.26■■■■■ 4.03
RAD54L2Q9Y4B4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC40.26■■■■■ 4.03
RAD54L2Q9Y4B4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
RAD54L2Q9Y4B4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
RAD54L2Q9Y4B4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC40.25■■■■■ 4.03
RAD54L2Q9Y4B4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
RAD54L2Q9Y4B4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
RAD54L2Q9Y4B4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
RAD54L2Q9Y4B4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC40.24■■■■■ 4.03
RAD54L2Q9Y4B4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
RAD54L2Q9Y4B4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
RAD54L2Q9Y4B4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
RAD54L2Q9Y4B4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC40.23■■■■■ 4.03
RAD54L2Q9Y4B4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC40.23■■■■■ 4.03
RAD54L2Q9Y4B4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC40.23■■■■■ 4.03
RAD54L2Q9Y4B4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC40.23■■■■■ 4.03
RAD54L2Q9Y4B4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC40.23■■■■■ 4.03
RAD54L2Q9Y4B4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
RAD54L2Q9Y4B4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
RAD54L2Q9Y4B4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC40.23■■■■■ 4.03
RAD54L2Q9Y4B4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC40.22■■■■■ 4.03
RAD54L2Q9Y4B4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.22■■■■■ 4.03
RAD54L2Q9Y4B4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC40.22■■■■■ 4.03
RAD54L2Q9Y4B4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC40.21■■■■■ 4.03
RAD54L2Q9Y4B4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC40.21■■■■■ 4.03
RAD54L2Q9Y4B4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
RAD54L2Q9Y4B4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.21■■■■■ 4.03
RAD54L2Q9Y4B4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC40.21■■■■■ 4.03
RAD54L2Q9Y4B4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
RAD54L2Q9Y4B4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
RAD54L2Q9Y4B4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
RAD54L2Q9Y4B4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
RAD54L2Q9Y4B4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC40.18■■■■■ 4.02
RAD54L2Q9Y4B4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.18■■■■■ 4.02
RAD54L2Q9Y4B4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
RAD54L2Q9Y4B4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
RAD54L2Q9Y4B4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
RAD54L2Q9Y4B4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC40.17■■■■■ 4.02
RAD54L2Q9Y4B4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC40.17■■■■■ 4.02
RAD54L2Q9Y4B4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
RAD54L2Q9Y4B4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC40.16■■■■■ 4.02
RAD54L2Q9Y4B4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC40.16■■■■■ 4.02
RAD54L2Q9Y4B4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC40.16■■■■■ 4.02
RAD54L2Q9Y4B4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC40.16■■■■■ 4.02
RAD54L2Q9Y4B4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
RAD54L2Q9Y4B4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC40.15■■■■■ 4.02
RAD54L2Q9Y4B4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
RAD54L2Q9Y4B4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
RAD54L2Q9Y4B4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
RAD54L2Q9Y4B4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
RAD54L2Q9Y4B4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.02
RAD54L2Q9Y4B4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC40.13■■■■■ 4.01
RAD54L2Q9Y4B4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC40.13■■■■■ 4.01
RAD54L2Q9Y4B4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC40.13■■■■■ 4.01
RAD54L2Q9Y4B4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.13■■■■■ 4.01
RAD54L2Q9Y4B4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
RAD54L2Q9Y4B4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
RAD54L2Q9Y4B4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
RAD54L2Q9Y4B4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC40.12■■■■■ 4.01
RAD54L2Q9Y4B4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC40.12■■■■■ 4.01
RAD54L2Q9Y4B4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
RAD54L2Q9Y4B4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC40.11■■■■■ 4.01
RAD54L2Q9Y4B4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.11■■■■■ 4.01
RAD54L2Q9Y4B4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
RAD54L2Q9Y4B4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC40.1■■■■■ 4.01
RAD54L2Q9Y4B4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
RAD54L2Q9Y4B4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC40.1■■■■■ 4.01
RAD54L2Q9Y4B4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC40.1■■■■■ 4.01
RAD54L2Q9Y4B4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC40.1■■■■■ 4.01
RAD54L2Q9Y4B4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
RAD54L2Q9Y4B4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC40.08■■■■■ 4.01
RAD54L2Q9Y4B4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
RAD54L2Q9Y4B4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC40.07■■■■■ 4.01
RAD54L2Q9Y4B4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
RAD54L2Q9Y4B4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC40.07■■■■■ 4
RAD54L2Q9Y4B4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC40.07■■■■■ 4
RAD54L2Q9Y4B4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC40.07■■■■■ 4
RAD54L2Q9Y4B4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
RAD54L2Q9Y4B4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
RAD54L2Q9Y4B4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
RAD54L2Q9Y4B4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
RAD54L2Q9Y4B4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.05■■■■■ 4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms