Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2P4

SLC27A6, Long-chain fatty acid transport protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A6Q9Y2P4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC27A6Q9Y2P4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC27A6Q9Y2P4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC27A6Q9Y2P4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC27A6Q9Y2P4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC27A6Q9Y2P4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC27A6Q9Y2P4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC27A6Q9Y2P4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC27A6Q9Y2P4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC27A6Q9Y2P4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC27A6Q9Y2P4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC27A6Q9Y2P4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC27A6Q9Y2P4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC27A6Q9Y2P4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC27A6Q9Y2P4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC27A6Q9Y2P4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC27A6Q9Y2P4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC27A6Q9Y2P4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC27A6Q9Y2P4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC27A6Q9Y2P4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC27A6Q9Y2P4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC27A6Q9Y2P4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC27A6Q9Y2P4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC27A6Q9Y2P4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC27A6Q9Y2P4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC27A6Q9Y2P4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC27A6Q9Y2P4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC27A6Q9Y2P4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC27A6Q9Y2P4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC27A6Q9Y2P4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC27A6Q9Y2P4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC27A6Q9Y2P4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SLC27A6Q9Y2P4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC27A6Q9Y2P4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC27A6Q9Y2P4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC27A6Q9Y2P4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC27A6Q9Y2P4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC27A6Q9Y2P4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC27A6Q9Y2P4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC27A6Q9Y2P4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC27A6Q9Y2P4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLC27A6Q9Y2P4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC27A6Q9Y2P4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC27A6Q9Y2P4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC27A6Q9Y2P4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC27A6Q9Y2P4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC27A6Q9Y2P4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC27A6Q9Y2P4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC27A6Q9Y2P4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC27A6Q9Y2P4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SLC27A6Q9Y2P4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC27A6Q9Y2P4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC27A6Q9Y2P4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC27A6Q9Y2P4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC27A6Q9Y2P4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SLC27A6Q9Y2P4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SLC27A6Q9Y2P4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC27A6Q9Y2P4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC27A6Q9Y2P4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC27A6Q9Y2P4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC27A6Q9Y2P4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC27A6Q9Y2P4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC27A6Q9Y2P4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC27A6Q9Y2P4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC27A6Q9Y2P4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SLC27A6Q9Y2P4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC27A6Q9Y2P4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC27A6Q9Y2P4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC27A6Q9Y2P4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC27A6Q9Y2P4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC27A6Q9Y2P4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC27A6Q9Y2P4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC27A6Q9Y2P4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SLC27A6Q9Y2P4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC27A6Q9Y2P4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC27A6Q9Y2P4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC27A6Q9Y2P4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC27A6Q9Y2P4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC27A6Q9Y2P4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SLC27A6Q9Y2P4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC27A6Q9Y2P4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC27A6Q9Y2P4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC27A6Q9Y2P4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC27A6Q9Y2P4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SLC27A6Q9Y2P4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC27A6Q9Y2P4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC27A6Q9Y2P4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC27A6Q9Y2P4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC27A6Q9Y2P4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC27A6Q9Y2P4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC27A6Q9Y2P4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC27A6Q9Y2P4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC27A6Q9Y2P4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SLC27A6Q9Y2P4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC27A6Q9Y2P4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC27A6Q9Y2P4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC27A6Q9Y2P4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC27A6Q9Y2P4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC27A6Q9Y2P4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC27A6Q9Y2P4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms