Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I1

NISCH, Nischarin, humanhuman

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Length 1,504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCHQ9Y2I1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC56.21■■■■■ 6.59
NISCHQ9Y2I1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC56.21■■■■■ 6.59
NISCHQ9Y2I1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC56.21■■■■■ 6.59
NISCHQ9Y2I1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC56.21■■■■■ 6.59
NISCHQ9Y2I1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC56.21■■■■■ 6.59
NISCHQ9Y2I1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC56.2■■■■■ 6.59
NISCHQ9Y2I1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC56.2■■■■■ 6.59
NISCHQ9Y2I1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC56.2■■■■■ 6.59
NISCHQ9Y2I1 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC56.2■■■■■ 6.59
NISCHQ9Y2I1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC56.19■■■■■ 6.59
NISCHQ9Y2I1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC56.19■■■■■ 6.59
NISCHQ9Y2I1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC56.19■■■■■ 6.59
NISCHQ9Y2I1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC56.18■■■■■ 6.58
NISCHQ9Y2I1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC56.18■■■■■ 6.58
NISCHQ9Y2I1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC56.18■■■■■ 6.58
NISCHQ9Y2I1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.17■■■■■ 6.58
NISCHQ9Y2I1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC56.17■■■■■ 6.58
NISCHQ9Y2I1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC56.17■■■■■ 6.58
NISCHQ9Y2I1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.16■■■■■ 6.58
NISCHQ9Y2I1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC56.15■■■■■ 6.58
NISCHQ9Y2I1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC56.15■■■■■ 6.58
NISCHQ9Y2I1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC56.15■■■■■ 6.58
NISCHQ9Y2I1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC56.14■■■■■ 6.58
NISCHQ9Y2I1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC56.14■■■■■ 6.58
NISCHQ9Y2I1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC56.14■■■■■ 6.58
NISCHQ9Y2I1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC56.13■■■■■ 6.58
NISCHQ9Y2I1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC56.13■■■■■ 6.58
NISCHQ9Y2I1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC56.13■■■■■ 6.58
NISCHQ9Y2I1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC56.13■■■■■ 6.58
NISCHQ9Y2I1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC56.12■■■■■ 6.57
NISCHQ9Y2I1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC56.12■■■■■ 6.57
NISCHQ9Y2I1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC56.12■■■■■ 6.57
NISCHQ9Y2I1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC56.11■■■■■ 6.57
NISCHQ9Y2I1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC56.11■■■■■ 6.57
NISCHQ9Y2I1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC56.09■■■■■ 6.57
NISCHQ9Y2I1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC56.09■■■■■ 6.57
NISCHQ9Y2I1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC56.09■■■■■ 6.57
NISCHQ9Y2I1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC56.07■■■■■ 6.57
NISCHQ9Y2I1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC56.07■■■■■ 6.57
NISCHQ9Y2I1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC56.06■■■■■ 6.57
NISCHQ9Y2I1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.06■■■■■ 6.56
NISCHQ9Y2I1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC56.05■■■■■ 6.56
NISCHQ9Y2I1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC56.05■■■■■ 6.56
NISCHQ9Y2I1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC56.05■■■■■ 6.56
NISCHQ9Y2I1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC56.05■■■■■ 6.56
NISCHQ9Y2I1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.04■■■■■ 6.56
NISCHQ9Y2I1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC56.03■■■■■ 6.56
NISCHQ9Y2I1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC56.03■■■■■ 6.56
NISCHQ9Y2I1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.02■■■■■ 6.56
NISCHQ9Y2I1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC56.02■■■■■ 6.56
NISCHQ9Y2I1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC56.02■■■■■ 6.56
NISCHQ9Y2I1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC56.02■■■■■ 6.56
NISCHQ9Y2I1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.01■■■■■ 6.56
NISCHQ9Y2I1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC56.01■■■■■ 6.56
NISCHQ9Y2I1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC56■■■■■ 6.56
NISCHQ9Y2I1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC56■■■■■ 6.55
NISCHQ9Y2I1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC56■■■■■ 6.55
NISCHQ9Y2I1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.98■■■■■ 6.55
NISCHQ9Y2I1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC55.97■■■■■ 6.55
NISCHQ9Y2I1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.97■■■■■ 6.55
NISCHQ9Y2I1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC55.97■■■■■ 6.55
NISCHQ9Y2I1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC55.95■■■■■ 6.55
NISCHQ9Y2I1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC55.95■■■■■ 6.55
NISCHQ9Y2I1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC55.95■■■■■ 6.55
NISCHQ9Y2I1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC55.95■■■■■ 6.55
NISCHQ9Y2I1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC55.95■■■■■ 6.55
NISCHQ9Y2I1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC55.95■■■■■ 6.55
NISCHQ9Y2I1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC55.95■■■■■ 6.55
NISCHQ9Y2I1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC55.94■■■■■ 6.55
NISCHQ9Y2I1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC55.94■■■■■ 6.55
NISCHQ9Y2I1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC55.94■■■■■ 6.55
NISCHQ9Y2I1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.93■■■■■ 6.54
NISCHQ9Y2I1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.93■■■■■ 6.54
NISCHQ9Y2I1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC55.93■■■■■ 6.54
NISCHQ9Y2I1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC55.92■■■■■ 6.54
NISCHQ9Y2I1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC55.92■■■■■ 6.54
NISCHQ9Y2I1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC55.92■■■■■ 6.54
NISCHQ9Y2I1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC55.92■■■■■ 6.54
NISCHQ9Y2I1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC55.92■■■■■ 6.54
NISCHQ9Y2I1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC55.92■■■■■ 6.54
NISCHQ9Y2I1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC55.92■■■■■ 6.54
NISCHQ9Y2I1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC55.91■■■■■ 6.54
NISCHQ9Y2I1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.91■■■■■ 6.54
NISCHQ9Y2I1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC55.91■■■■■ 6.54
NISCHQ9Y2I1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC55.91■■■■■ 6.54
NISCHQ9Y2I1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC55.89■■■■■ 6.54
NISCHQ9Y2I1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC55.87■■■■■ 6.54
NISCHQ9Y2I1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC55.87■■■■■ 6.53
NISCHQ9Y2I1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC55.87■■■■■ 6.53
NISCHQ9Y2I1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC55.86■■■■■ 6.53
NISCHQ9Y2I1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC55.86■■■■■ 6.53
NISCHQ9Y2I1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC55.86■■■■■ 6.53
NISCHQ9Y2I1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC55.85■■■■■ 6.53
NISCHQ9Y2I1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.85■■■■■ 6.53
NISCHQ9Y2I1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.85■■■■■ 6.53
NISCHQ9Y2I1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC55.85■■■■■ 6.53
NISCHQ9Y2I1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC55.85■■■■■ 6.53
NISCHQ9Y2I1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC55.85■■■■■ 6.53
NISCHQ9Y2I1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC55.85■■■■■ 6.53
NISCHQ9Y2I1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC55.85■■■■■ 6.53
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