Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2B5

VPS9D1, VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS9D1Q9Y2B5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VPS9D1Q9Y2B5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VPS9D1Q9Y2B5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VPS9D1Q9Y2B5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VPS9D1Q9Y2B5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VPS9D1Q9Y2B5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VPS9D1Q9Y2B5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VPS9D1Q9Y2B5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VPS9D1Q9Y2B5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VPS9D1Q9Y2B5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VPS9D1Q9Y2B5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VPS9D1Q9Y2B5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VPS9D1Q9Y2B5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VPS9D1Q9Y2B5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VPS9D1Q9Y2B5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VPS9D1Q9Y2B5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VPS9D1Q9Y2B5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VPS9D1Q9Y2B5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VPS9D1Q9Y2B5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VPS9D1Q9Y2B5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VPS9D1Q9Y2B5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VPS9D1Q9Y2B5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VPS9D1Q9Y2B5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VPS9D1Q9Y2B5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VPS9D1Q9Y2B5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VPS9D1Q9Y2B5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
VPS9D1Q9Y2B5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VPS9D1Q9Y2B5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
VPS9D1Q9Y2B5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VPS9D1Q9Y2B5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
VPS9D1Q9Y2B5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VPS9D1Q9Y2B5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VPS9D1Q9Y2B5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VPS9D1Q9Y2B5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VPS9D1Q9Y2B5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VPS9D1Q9Y2B5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VPS9D1Q9Y2B5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VPS9D1Q9Y2B5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VPS9D1Q9Y2B5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VPS9D1Q9Y2B5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VPS9D1Q9Y2B5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VPS9D1Q9Y2B5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VPS9D1Q9Y2B5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
VPS9D1Q9Y2B5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VPS9D1Q9Y2B5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
VPS9D1Q9Y2B5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VPS9D1Q9Y2B5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VPS9D1Q9Y2B5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VPS9D1Q9Y2B5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VPS9D1Q9Y2B5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VPS9D1Q9Y2B5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VPS9D1Q9Y2B5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VPS9D1Q9Y2B5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VPS9D1Q9Y2B5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VPS9D1Q9Y2B5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VPS9D1Q9Y2B5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VPS9D1Q9Y2B5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VPS9D1Q9Y2B5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VPS9D1Q9Y2B5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VPS9D1Q9Y2B5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VPS9D1Q9Y2B5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VPS9D1Q9Y2B5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VPS9D1Q9Y2B5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VPS9D1Q9Y2B5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VPS9D1Q9Y2B5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VPS9D1Q9Y2B5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VPS9D1Q9Y2B5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS9D1Q9Y2B5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS9D1Q9Y2B5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS9D1Q9Y2B5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS9D1Q9Y2B5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS9D1Q9Y2B5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS9D1Q9Y2B5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS9D1Q9Y2B5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS9D1Q9Y2B5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS9D1Q9Y2B5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS9D1Q9Y2B5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS9D1Q9Y2B5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
VPS9D1Q9Y2B5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
VPS9D1Q9Y2B5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
VPS9D1Q9Y2B5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS9D1Q9Y2B5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS9D1Q9Y2B5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS9D1Q9Y2B5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS9D1Q9Y2B5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS9D1Q9Y2B5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS9D1Q9Y2B5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS9D1Q9Y2B5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS9D1Q9Y2B5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS9D1Q9Y2B5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS9D1Q9Y2B5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS9D1Q9Y2B5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS9D1Q9Y2B5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS9D1Q9Y2B5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS9D1Q9Y2B5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS9D1Q9Y2B5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS9D1Q9Y2B5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS9D1Q9Y2B5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS9D1Q9Y2B5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS9D1Q9Y2B5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms