Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN75

PCDHA12, Protocadherin alpha-12, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA12Q9UN75 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCDHA12Q9UN75 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCDHA12Q9UN75 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCDHA12Q9UN75 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCDHA12Q9UN75 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCDHA12Q9UN75 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCDHA12Q9UN75 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCDHA12Q9UN75 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCDHA12Q9UN75 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCDHA12Q9UN75 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCDHA12Q9UN75 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCDHA12Q9UN75 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PCDHA12Q9UN75 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCDHA12Q9UN75 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCDHA12Q9UN75 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCDHA12Q9UN75 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCDHA12Q9UN75 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PCDHA12Q9UN75 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCDHA12Q9UN75 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PCDHA12Q9UN75 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCDHA12Q9UN75 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCDHA12Q9UN75 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCDHA12Q9UN75 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCDHA12Q9UN75 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCDHA12Q9UN75 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCDHA12Q9UN75 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCDHA12Q9UN75 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCDHA12Q9UN75 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCDHA12Q9UN75 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCDHA12Q9UN75 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCDHA12Q9UN75 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCDHA12Q9UN75 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCDHA12Q9UN75 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PCDHA12Q9UN75 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PCDHA12Q9UN75 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PCDHA12Q9UN75 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PCDHA12Q9UN75 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PCDHA12Q9UN75 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PCDHA12Q9UN75 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PCDHA12Q9UN75 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PCDHA12Q9UN75 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
PCDHA12Q9UN75 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PCDHA12Q9UN75 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PCDHA12Q9UN75 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PCDHA12Q9UN75 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PCDHA12Q9UN75 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PCDHA12Q9UN75 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PCDHA12Q9UN75 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PCDHA12Q9UN75 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PCDHA12Q9UN75 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PCDHA12Q9UN75 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PCDHA12Q9UN75 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PCDHA12Q9UN75 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PCDHA12Q9UN75 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PCDHA12Q9UN75 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PCDHA12Q9UN75 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PCDHA12Q9UN75 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PCDHA12Q9UN75 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PCDHA12Q9UN75 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PCDHA12Q9UN75 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PCDHA12Q9UN75 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCDHA12Q9UN75 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCDHA12Q9UN75 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCDHA12Q9UN75 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCDHA12Q9UN75 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCDHA12Q9UN75 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCDHA12Q9UN75 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCDHA12Q9UN75 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCDHA12Q9UN75 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PCDHA12Q9UN75 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PCDHA12Q9UN75 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PCDHA12Q9UN75 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PCDHA12Q9UN75 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PCDHA12Q9UN75 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PCDHA12Q9UN75 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PCDHA12Q9UN75 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PCDHA12Q9UN75 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PCDHA12Q9UN75 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PCDHA12Q9UN75 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PCDHA12Q9UN75 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PCDHA12Q9UN75 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PCDHA12Q9UN75 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PCDHA12Q9UN75 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PCDHA12Q9UN75 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PCDHA12Q9UN75 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PCDHA12Q9UN75 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PCDHA12Q9UN75 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PCDHA12Q9UN75 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PCDHA12Q9UN75 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
PCDHA12Q9UN75 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PCDHA12Q9UN75 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PCDHA12Q9UN75 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PCDHA12Q9UN75 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PCDHA12Q9UN75 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PCDHA12Q9UN75 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PCDHA12Q9UN75 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PCDHA12Q9UN75 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PCDHA12Q9UN75 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PCDHA12Q9UN75 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PCDHA12Q9UN75 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms