Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV0

HDAC9, Histone deacetylase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC9Q9UKV0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
HDAC9Q9UKV0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
HDAC9Q9UKV0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
HDAC9Q9UKV0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
HDAC9Q9UKV0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
HDAC9Q9UKV0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
HDAC9Q9UKV0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
HDAC9Q9UKV0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HDAC9Q9UKV0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
HDAC9Q9UKV0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HDAC9Q9UKV0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
HDAC9Q9UKV0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
HDAC9Q9UKV0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HDAC9Q9UKV0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HDAC9Q9UKV0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
HDAC9Q9UKV0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
HDAC9Q9UKV0 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
HDAC9Q9UKV0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
HDAC9Q9UKV0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
HDAC9Q9UKV0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
HDAC9Q9UKV0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
HDAC9Q9UKV0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
HDAC9Q9UKV0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HDAC9Q9UKV0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HDAC9Q9UKV0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
HDAC9Q9UKV0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
HDAC9Q9UKV0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HDAC9Q9UKV0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
HDAC9Q9UKV0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
HDAC9Q9UKV0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
HDAC9Q9UKV0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
HDAC9Q9UKV0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
HDAC9Q9UKV0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
HDAC9Q9UKV0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
HDAC9Q9UKV0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
HDAC9Q9UKV0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
HDAC9Q9UKV0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
HDAC9Q9UKV0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
HDAC9Q9UKV0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
HDAC9Q9UKV0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HDAC9Q9UKV0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
HDAC9Q9UKV0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
HDAC9Q9UKV0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
HDAC9Q9UKV0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HDAC9Q9UKV0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HDAC9Q9UKV0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HDAC9Q9UKV0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
HDAC9Q9UKV0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
HDAC9Q9UKV0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
HDAC9Q9UKV0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
HDAC9Q9UKV0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
HDAC9Q9UKV0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
HDAC9Q9UKV0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
HDAC9Q9UKV0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
HDAC9Q9UKV0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
HDAC9Q9UKV0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
HDAC9Q9UKV0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
HDAC9Q9UKV0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
HDAC9Q9UKV0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
HDAC9Q9UKV0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
HDAC9Q9UKV0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
HDAC9Q9UKV0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
HDAC9Q9UKV0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
HDAC9Q9UKV0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
HDAC9Q9UKV0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
HDAC9Q9UKV0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
HDAC9Q9UKV0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
HDAC9Q9UKV0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
HDAC9Q9UKV0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
HDAC9Q9UKV0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
HDAC9Q9UKV0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
HDAC9Q9UKV0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
HDAC9Q9UKV0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
HDAC9Q9UKV0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
HDAC9Q9UKV0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
HDAC9Q9UKV0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
HDAC9Q9UKV0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
HDAC9Q9UKV0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
HDAC9Q9UKV0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
HDAC9Q9UKV0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
HDAC9Q9UKV0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
HDAC9Q9UKV0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
HDAC9Q9UKV0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
HDAC9Q9UKV0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
HDAC9Q9UKV0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
HDAC9Q9UKV0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
HDAC9Q9UKV0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
HDAC9Q9UKV0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
HDAC9Q9UKV0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
HDAC9Q9UKV0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
HDAC9Q9UKV0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
HDAC9Q9UKV0 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
HDAC9Q9UKV0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
HDAC9Q9UKV0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
HDAC9Q9UKV0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
HDAC9Q9UKV0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
HDAC9Q9UKV0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
HDAC9Q9UKV0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
HDAC9Q9UKV0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
HDAC9Q9UKV0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150.4 ms