Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKU0

ACSL6, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 6, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL6Q9UKU0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACSL6Q9UKU0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACSL6Q9UKU0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACSL6Q9UKU0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACSL6Q9UKU0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACSL6Q9UKU0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ACSL6Q9UKU0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACSL6Q9UKU0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACSL6Q9UKU0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACSL6Q9UKU0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACSL6Q9UKU0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACSL6Q9UKU0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACSL6Q9UKU0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACSL6Q9UKU0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACSL6Q9UKU0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ACSL6Q9UKU0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACSL6Q9UKU0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACSL6Q9UKU0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACSL6Q9UKU0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACSL6Q9UKU0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACSL6Q9UKU0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACSL6Q9UKU0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACSL6Q9UKU0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACSL6Q9UKU0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACSL6Q9UKU0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACSL6Q9UKU0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACSL6Q9UKU0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACSL6Q9UKU0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACSL6Q9UKU0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACSL6Q9UKU0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACSL6Q9UKU0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACSL6Q9UKU0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACSL6Q9UKU0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ACSL6Q9UKU0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACSL6Q9UKU0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACSL6Q9UKU0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACSL6Q9UKU0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACSL6Q9UKU0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACSL6Q9UKU0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACSL6Q9UKU0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACSL6Q9UKU0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACSL6Q9UKU0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACSL6Q9UKU0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACSL6Q9UKU0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACSL6Q9UKU0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACSL6Q9UKU0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACSL6Q9UKU0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACSL6Q9UKU0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACSL6Q9UKU0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACSL6Q9UKU0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACSL6Q9UKU0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACSL6Q9UKU0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACSL6Q9UKU0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACSL6Q9UKU0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACSL6Q9UKU0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACSL6Q9UKU0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACSL6Q9UKU0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACSL6Q9UKU0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACSL6Q9UKU0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACSL6Q9UKU0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACSL6Q9UKU0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ACSL6Q9UKU0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACSL6Q9UKU0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACSL6Q9UKU0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACSL6Q9UKU0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACSL6Q9UKU0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACSL6Q9UKU0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACSL6Q9UKU0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACSL6Q9UKU0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACSL6Q9UKU0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACSL6Q9UKU0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACSL6Q9UKU0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ACSL6Q9UKU0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACSL6Q9UKU0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACSL6Q9UKU0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACSL6Q9UKU0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACSL6Q9UKU0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACSL6Q9UKU0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACSL6Q9UKU0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACSL6Q9UKU0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACSL6Q9UKU0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ACSL6Q9UKU0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACSL6Q9UKU0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACSL6Q9UKU0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACSL6Q9UKU0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACSL6Q9UKU0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ACSL6Q9UKU0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACSL6Q9UKU0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACSL6Q9UKU0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACSL6Q9UKU0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACSL6Q9UKU0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACSL6Q9UKU0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACSL6Q9UKU0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACSL6Q9UKU0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACSL6Q9UKU0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACSL6Q9UKU0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ACSL6Q9UKU0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACSL6Q9UKU0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACSL6Q9UKU0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACSL6Q9UKU0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms