Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKQ2

ADAM28, Disintegrin and metalloproteinase domain-containing protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ADAM28Q9UKQ2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ADAM28Q9UKQ2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ADAM28Q9UKQ2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ADAM28Q9UKQ2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ADAM28Q9UKQ2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ADAM28Q9UKQ2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ADAM28Q9UKQ2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ADAM28Q9UKQ2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ADAM28Q9UKQ2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ADAM28Q9UKQ2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ADAM28Q9UKQ2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ADAM28Q9UKQ2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ADAM28Q9UKQ2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ADAM28Q9UKQ2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ADAM28Q9UKQ2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ADAM28Q9UKQ2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ADAM28Q9UKQ2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ADAM28Q9UKQ2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ADAM28Q9UKQ2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ADAM28Q9UKQ2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ADAM28Q9UKQ2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ADAM28Q9UKQ2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ADAM28Q9UKQ2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ADAM28Q9UKQ2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ADAM28Q9UKQ2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ADAM28Q9UKQ2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ADAM28Q9UKQ2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ADAM28Q9UKQ2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ADAM28Q9UKQ2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ADAM28Q9UKQ2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ADAM28Q9UKQ2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ADAM28Q9UKQ2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ADAM28Q9UKQ2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ADAM28Q9UKQ2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ADAM28Q9UKQ2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ADAM28Q9UKQ2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ADAM28Q9UKQ2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ADAM28Q9UKQ2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ADAM28Q9UKQ2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ADAM28Q9UKQ2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ADAM28Q9UKQ2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ADAM28Q9UKQ2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ADAM28Q9UKQ2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ADAM28Q9UKQ2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ADAM28Q9UKQ2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ADAM28Q9UKQ2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ADAM28Q9UKQ2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ADAM28Q9UKQ2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ADAM28Q9UKQ2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ADAM28Q9UKQ2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ADAM28Q9UKQ2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ADAM28Q9UKQ2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ADAM28Q9UKQ2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ADAM28Q9UKQ2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ADAM28Q9UKQ2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ADAM28Q9UKQ2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ADAM28Q9UKQ2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ADAM28Q9UKQ2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
ADAM28Q9UKQ2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ADAM28Q9UKQ2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ADAM28Q9UKQ2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ADAM28Q9UKQ2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ADAM28Q9UKQ2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ADAM28Q9UKQ2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ADAM28Q9UKQ2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ADAM28Q9UKQ2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ADAM28Q9UKQ2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ADAM28Q9UKQ2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ADAM28Q9UKQ2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ADAM28Q9UKQ2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ADAM28Q9UKQ2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ADAM28Q9UKQ2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ADAM28Q9UKQ2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ADAM28Q9UKQ2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ADAM28Q9UKQ2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ADAM28Q9UKQ2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ADAM28Q9UKQ2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ADAM28Q9UKQ2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ADAM28Q9UKQ2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ADAM28Q9UKQ2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ADAM28Q9UKQ2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ADAM28Q9UKQ2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ADAM28Q9UKQ2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ADAM28Q9UKQ2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ADAM28Q9UKQ2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ADAM28Q9UKQ2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ADAM28Q9UKQ2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ADAM28Q9UKQ2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ADAM28Q9UKQ2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ADAM28Q9UKQ2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ADAM28Q9UKQ2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ADAM28Q9UKQ2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ADAM28Q9UKQ2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ADAM28Q9UKQ2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ADAM28Q9UKQ2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ADAM28Q9UKQ2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ADAM28Q9UKQ2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ADAM28Q9UKQ2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ADAM28Q9UKQ2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ADAM28Q9UKQ2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 163 ms