Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG1

APPL1, DCC-interacting protein 13-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APPL1Q9UKG1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
APPL1Q9UKG1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
APPL1Q9UKG1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
APPL1Q9UKG1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
APPL1Q9UKG1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
APPL1Q9UKG1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
APPL1Q9UKG1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
APPL1Q9UKG1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
APPL1Q9UKG1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
APPL1Q9UKG1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
APPL1Q9UKG1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
APPL1Q9UKG1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
APPL1Q9UKG1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
APPL1Q9UKG1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
APPL1Q9UKG1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
APPL1Q9UKG1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
APPL1Q9UKG1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
APPL1Q9UKG1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
APPL1Q9UKG1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
APPL1Q9UKG1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
APPL1Q9UKG1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
APPL1Q9UKG1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APPL1Q9UKG1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
APPL1Q9UKG1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
APPL1Q9UKG1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
APPL1Q9UKG1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
APPL1Q9UKG1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
APPL1Q9UKG1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APPL1Q9UKG1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
APPL1Q9UKG1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
APPL1Q9UKG1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
APPL1Q9UKG1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
APPL1Q9UKG1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
APPL1Q9UKG1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
APPL1Q9UKG1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
APPL1Q9UKG1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
APPL1Q9UKG1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
APPL1Q9UKG1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APPL1Q9UKG1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
APPL1Q9UKG1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APPL1Q9UKG1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
APPL1Q9UKG1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APPL1Q9UKG1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APPL1Q9UKG1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
APPL1Q9UKG1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
APPL1Q9UKG1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
APPL1Q9UKG1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
APPL1Q9UKG1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
APPL1Q9UKG1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
APPL1Q9UKG1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
APPL1Q9UKG1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
APPL1Q9UKG1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
APPL1Q9UKG1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
APPL1Q9UKG1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
APPL1Q9UKG1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
APPL1Q9UKG1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
APPL1Q9UKG1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
APPL1Q9UKG1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
APPL1Q9UKG1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
APPL1Q9UKG1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
APPL1Q9UKG1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
APPL1Q9UKG1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
APPL1Q9UKG1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
APPL1Q9UKG1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
APPL1Q9UKG1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
APPL1Q9UKG1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
APPL1Q9UKG1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
APPL1Q9UKG1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
APPL1Q9UKG1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
APPL1Q9UKG1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
APPL1Q9UKG1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
APPL1Q9UKG1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
APPL1Q9UKG1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
APPL1Q9UKG1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
APPL1Q9UKG1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
APPL1Q9UKG1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
APPL1Q9UKG1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
APPL1Q9UKG1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
APPL1Q9UKG1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
APPL1Q9UKG1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
APPL1Q9UKG1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
APPL1Q9UKG1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
APPL1Q9UKG1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
APPL1Q9UKG1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
APPL1Q9UKG1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
APPL1Q9UKG1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
APPL1Q9UKG1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
APPL1Q9UKG1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
APPL1Q9UKG1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
APPL1Q9UKG1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
APPL1Q9UKG1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
APPL1Q9UKG1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
APPL1Q9UKG1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
APPL1Q9UKG1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
APPL1Q9UKG1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
APPL1Q9UKG1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
APPL1Q9UKG1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
APPL1Q9UKG1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
APPL1Q9UKG1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
APPL1Q9UKG1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.3 ms