Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIL8

PHF11, PHD finger protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF11Q9UIL8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHF11Q9UIL8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHF11Q9UIL8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHF11Q9UIL8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PHF11Q9UIL8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHF11Q9UIL8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHF11Q9UIL8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHF11Q9UIL8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PHF11Q9UIL8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHF11Q9UIL8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHF11Q9UIL8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHF11Q9UIL8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHF11Q9UIL8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHF11Q9UIL8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHF11Q9UIL8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHF11Q9UIL8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHF11Q9UIL8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHF11Q9UIL8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHF11Q9UIL8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHF11Q9UIL8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHF11Q9UIL8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHF11Q9UIL8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHF11Q9UIL8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHF11Q9UIL8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHF11Q9UIL8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHF11Q9UIL8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHF11Q9UIL8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHF11Q9UIL8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHF11Q9UIL8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHF11Q9UIL8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PHF11Q9UIL8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHF11Q9UIL8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHF11Q9UIL8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHF11Q9UIL8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHF11Q9UIL8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PHF11Q9UIL8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHF11Q9UIL8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHF11Q9UIL8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHF11Q9UIL8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHF11Q9UIL8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHF11Q9UIL8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHF11Q9UIL8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHF11Q9UIL8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHF11Q9UIL8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHF11Q9UIL8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHF11Q9UIL8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PHF11Q9UIL8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHF11Q9UIL8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHF11Q9UIL8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHF11Q9UIL8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHF11Q9UIL8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHF11Q9UIL8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHF11Q9UIL8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHF11Q9UIL8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PHF11Q9UIL8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHF11Q9UIL8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHF11Q9UIL8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHF11Q9UIL8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHF11Q9UIL8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHF11Q9UIL8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHF11Q9UIL8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHF11Q9UIL8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHF11Q9UIL8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHF11Q9UIL8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHF11Q9UIL8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PHF11Q9UIL8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHF11Q9UIL8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHF11Q9UIL8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHF11Q9UIL8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHF11Q9UIL8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHF11Q9UIL8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PHF11Q9UIL8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHF11Q9UIL8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHF11Q9UIL8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHF11Q9UIL8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHF11Q9UIL8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PHF11Q9UIL8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHF11Q9UIL8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHF11Q9UIL8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHF11Q9UIL8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHF11Q9UIL8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHF11Q9UIL8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PHF11Q9UIL8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHF11Q9UIL8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHF11Q9UIL8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHF11Q9UIL8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PHF11Q9UIL8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHF11Q9UIL8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PHF11Q9UIL8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHF11Q9UIL8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHF11Q9UIL8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHF11Q9UIL8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHF11Q9UIL8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHF11Q9UIL8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHF11Q9UIL8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHF11Q9UIL8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHF11Q9UIL8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PHF11Q9UIL8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHF11Q9UIL8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHF11Q9UIL8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms