Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIA0

CYTH4, Cytohesin-4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH4Q9UIA0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CYTH4Q9UIA0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CYTH4Q9UIA0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CYTH4Q9UIA0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CYTH4Q9UIA0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CYTH4Q9UIA0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CYTH4Q9UIA0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CYTH4Q9UIA0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CYTH4Q9UIA0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CYTH4Q9UIA0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CYTH4Q9UIA0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CYTH4Q9UIA0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CYTH4Q9UIA0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CYTH4Q9UIA0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CYTH4Q9UIA0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CYTH4Q9UIA0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CYTH4Q9UIA0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CYTH4Q9UIA0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CYTH4Q9UIA0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CYTH4Q9UIA0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CYTH4Q9UIA0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CYTH4Q9UIA0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CYTH4Q9UIA0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CYTH4Q9UIA0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CYTH4Q9UIA0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CYTH4Q9UIA0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CYTH4Q9UIA0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CYTH4Q9UIA0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CYTH4Q9UIA0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CYTH4Q9UIA0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CYTH4Q9UIA0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CYTH4Q9UIA0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CYTH4Q9UIA0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CYTH4Q9UIA0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CYTH4Q9UIA0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CYTH4Q9UIA0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CYTH4Q9UIA0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CYTH4Q9UIA0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CYTH4Q9UIA0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CYTH4Q9UIA0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CYTH4Q9UIA0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CYTH4Q9UIA0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CYTH4Q9UIA0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CYTH4Q9UIA0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CYTH4Q9UIA0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CYTH4Q9UIA0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CYTH4Q9UIA0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CYTH4Q9UIA0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CYTH4Q9UIA0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CYTH4Q9UIA0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CYTH4Q9UIA0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CYTH4Q9UIA0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CYTH4Q9UIA0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CYTH4Q9UIA0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CYTH4Q9UIA0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CYTH4Q9UIA0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CYTH4Q9UIA0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CYTH4Q9UIA0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CYTH4Q9UIA0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CYTH4Q9UIA0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CYTH4Q9UIA0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CYTH4Q9UIA0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CYTH4Q9UIA0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CYTH4Q9UIA0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CYTH4Q9UIA0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CYTH4Q9UIA0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CYTH4Q9UIA0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CYTH4Q9UIA0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CYTH4Q9UIA0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CYTH4Q9UIA0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CYTH4Q9UIA0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CYTH4Q9UIA0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CYTH4Q9UIA0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CYTH4Q9UIA0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CYTH4Q9UIA0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CYTH4Q9UIA0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CYTH4Q9UIA0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CYTH4Q9UIA0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CYTH4Q9UIA0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CYTH4Q9UIA0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CYTH4Q9UIA0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CYTH4Q9UIA0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CYTH4Q9UIA0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CYTH4Q9UIA0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CYTH4Q9UIA0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CYTH4Q9UIA0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CYTH4Q9UIA0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CYTH4Q9UIA0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CYTH4Q9UIA0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CYTH4Q9UIA0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CYTH4Q9UIA0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CYTH4Q9UIA0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CYTH4Q9UIA0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CYTH4Q9UIA0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CYTH4Q9UIA0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CYTH4Q9UIA0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CYTH4Q9UIA0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CYTH4Q9UIA0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CYTH4Q9UIA0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CYTH4Q9UIA0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms