Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GTF2IRD1Q9UHL9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GTF2IRD1Q9UHL9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GTF2IRD1Q9UHL9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GTF2IRD1Q9UHL9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GTF2IRD1Q9UHL9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
GTF2IRD1Q9UHL9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GTF2IRD1Q9UHL9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
GTF2IRD1Q9UHL9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GTF2IRD1Q9UHL9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GTF2IRD1Q9UHL9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GTF2IRD1Q9UHL9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GTF2IRD1Q9UHL9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GTF2IRD1Q9UHL9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GTF2IRD1Q9UHL9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GTF2IRD1Q9UHL9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GTF2IRD1Q9UHL9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GTF2IRD1Q9UHL9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
GTF2IRD1Q9UHL9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GTF2IRD1Q9UHL9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GTF2IRD1Q9UHL9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GTF2IRD1Q9UHL9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GTF2IRD1Q9UHL9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GTF2IRD1Q9UHL9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GTF2IRD1Q9UHL9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
GTF2IRD1Q9UHL9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GTF2IRD1Q9UHL9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GTF2IRD1Q9UHL9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GTF2IRD1Q9UHL9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GTF2IRD1Q9UHL9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GTF2IRD1Q9UHL9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GTF2IRD1Q9UHL9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GTF2IRD1Q9UHL9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GTF2IRD1Q9UHL9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GTF2IRD1Q9UHL9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GTF2IRD1Q9UHL9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GTF2IRD1Q9UHL9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GTF2IRD1Q9UHL9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GTF2IRD1Q9UHL9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GTF2IRD1Q9UHL9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GTF2IRD1Q9UHL9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GTF2IRD1Q9UHL9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GTF2IRD1Q9UHL9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GTF2IRD1Q9UHL9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GTF2IRD1Q9UHL9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GTF2IRD1Q9UHL9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GTF2IRD1Q9UHL9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GTF2IRD1Q9UHL9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GTF2IRD1Q9UHL9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GTF2IRD1Q9UHL9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GTF2IRD1Q9UHL9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GTF2IRD1Q9UHL9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GTF2IRD1Q9UHL9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
GTF2IRD1Q9UHL9 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GTF2IRD1Q9UHL9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GTF2IRD1Q9UHL9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GTF2IRD1Q9UHL9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GTF2IRD1Q9UHL9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GTF2IRD1Q9UHL9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GTF2IRD1Q9UHL9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GTF2IRD1Q9UHL9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GTF2IRD1Q9UHL9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GTF2IRD1Q9UHL9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GTF2IRD1Q9UHL9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GTF2IRD1Q9UHL9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GTF2IRD1Q9UHL9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GTF2IRD1Q9UHL9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
GTF2IRD1Q9UHL9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GTF2IRD1Q9UHL9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GTF2IRD1Q9UHL9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GTF2IRD1Q9UHL9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GTF2IRD1Q9UHL9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
GTF2IRD1Q9UHL9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GTF2IRD1Q9UHL9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GTF2IRD1Q9UHL9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GTF2IRD1Q9UHL9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GTF2IRD1Q9UHL9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GTF2IRD1Q9UHL9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GTF2IRD1Q9UHL9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GTF2IRD1Q9UHL9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GTF2IRD1Q9UHL9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
GTF2IRD1Q9UHL9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GTF2IRD1Q9UHL9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GTF2IRD1Q9UHL9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GTF2IRD1Q9UHL9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GTF2IRD1Q9UHL9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GTF2IRD1Q9UHL9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GTF2IRD1Q9UHL9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GTF2IRD1Q9UHL9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GTF2IRD1Q9UHL9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms