Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL0

DDX25, ATP-dependent RNA helicase DDX25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX25Q9UHL0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DDX25Q9UHL0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DDX25Q9UHL0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DDX25Q9UHL0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DDX25Q9UHL0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
DDX25Q9UHL0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DDX25Q9UHL0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DDX25Q9UHL0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DDX25Q9UHL0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
DDX25Q9UHL0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DDX25Q9UHL0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
DDX25Q9UHL0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
DDX25Q9UHL0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DDX25Q9UHL0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DDX25Q9UHL0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DDX25Q9UHL0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DDX25Q9UHL0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DDX25Q9UHL0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DDX25Q9UHL0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
DDX25Q9UHL0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
DDX25Q9UHL0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
DDX25Q9UHL0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
DDX25Q9UHL0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
DDX25Q9UHL0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DDX25Q9UHL0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DDX25Q9UHL0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DDX25Q9UHL0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DDX25Q9UHL0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
DDX25Q9UHL0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DDX25Q9UHL0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DDX25Q9UHL0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DDX25Q9UHL0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
DDX25Q9UHL0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
DDX25Q9UHL0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
DDX25Q9UHL0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DDX25Q9UHL0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
DDX25Q9UHL0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DDX25Q9UHL0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DDX25Q9UHL0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DDX25Q9UHL0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
DDX25Q9UHL0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DDX25Q9UHL0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DDX25Q9UHL0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DDX25Q9UHL0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
DDX25Q9UHL0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
DDX25Q9UHL0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DDX25Q9UHL0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
DDX25Q9UHL0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DDX25Q9UHL0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
DDX25Q9UHL0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
DDX25Q9UHL0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DDX25Q9UHL0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
DDX25Q9UHL0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DDX25Q9UHL0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
DDX25Q9UHL0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
DDX25Q9UHL0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
DDX25Q9UHL0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DDX25Q9UHL0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
DDX25Q9UHL0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
DDX25Q9UHL0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DDX25Q9UHL0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DDX25Q9UHL0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DDX25Q9UHL0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DDX25Q9UHL0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
DDX25Q9UHL0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
DDX25Q9UHL0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DDX25Q9UHL0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
DDX25Q9UHL0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DDX25Q9UHL0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DDX25Q9UHL0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
DDX25Q9UHL0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DDX25Q9UHL0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DDX25Q9UHL0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DDX25Q9UHL0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DDX25Q9UHL0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DDX25Q9UHL0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DDX25Q9UHL0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DDX25Q9UHL0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DDX25Q9UHL0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DDX25Q9UHL0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DDX25Q9UHL0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DDX25Q9UHL0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
DDX25Q9UHL0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DDX25Q9UHL0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DDX25Q9UHL0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
DDX25Q9UHL0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
DDX25Q9UHL0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
DDX25Q9UHL0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
DDX25Q9UHL0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
DDX25Q9UHL0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DDX25Q9UHL0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DDX25Q9UHL0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DDX25Q9UHL0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DDX25Q9UHL0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DDX25Q9UHL0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DDX25Q9UHL0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
DDX25Q9UHL0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
DDX25Q9UHL0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DDX25Q9UHL0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DDX25Q9UHL0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms