Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
APEX2Q9UBZ4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
APEX2Q9UBZ4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
APEX2Q9UBZ4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
APEX2Q9UBZ4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
APEX2Q9UBZ4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
APEX2Q9UBZ4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
APEX2Q9UBZ4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
APEX2Q9UBZ4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
APEX2Q9UBZ4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
APEX2Q9UBZ4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
APEX2Q9UBZ4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
APEX2Q9UBZ4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
APEX2Q9UBZ4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
APEX2Q9UBZ4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
APEX2Q9UBZ4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
APEX2Q9UBZ4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
APEX2Q9UBZ4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
APEX2Q9UBZ4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
APEX2Q9UBZ4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
APEX2Q9UBZ4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
APEX2Q9UBZ4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
APEX2Q9UBZ4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
APEX2Q9UBZ4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
APEX2Q9UBZ4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
APEX2Q9UBZ4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
APEX2Q9UBZ4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
APEX2Q9UBZ4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
APEX2Q9UBZ4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
APEX2Q9UBZ4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
APEX2Q9UBZ4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
APEX2Q9UBZ4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
APEX2Q9UBZ4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
APEX2Q9UBZ4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
APEX2Q9UBZ4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
APEX2Q9UBZ4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
APEX2Q9UBZ4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
APEX2Q9UBZ4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
APEX2Q9UBZ4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
APEX2Q9UBZ4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
APEX2Q9UBZ4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
APEX2Q9UBZ4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
APEX2Q9UBZ4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
APEX2Q9UBZ4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
APEX2Q9UBZ4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
APEX2Q9UBZ4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
APEX2Q9UBZ4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
APEX2Q9UBZ4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
APEX2Q9UBZ4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
APEX2Q9UBZ4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
APEX2Q9UBZ4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
APEX2Q9UBZ4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
APEX2Q9UBZ4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
APEX2Q9UBZ4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
APEX2Q9UBZ4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
APEX2Q9UBZ4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
APEX2Q9UBZ4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
APEX2Q9UBZ4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
APEX2Q9UBZ4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
APEX2Q9UBZ4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
APEX2Q9UBZ4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
APEX2Q9UBZ4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
APEX2Q9UBZ4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
APEX2Q9UBZ4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
APEX2Q9UBZ4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
APEX2Q9UBZ4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
APEX2Q9UBZ4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
APEX2Q9UBZ4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
APEX2Q9UBZ4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
APEX2Q9UBZ4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
APEX2Q9UBZ4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
APEX2Q9UBZ4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
APEX2Q9UBZ4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
APEX2Q9UBZ4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
APEX2Q9UBZ4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
APEX2Q9UBZ4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
APEX2Q9UBZ4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
APEX2Q9UBZ4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
APEX2Q9UBZ4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
APEX2Q9UBZ4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
APEX2Q9UBZ4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
APEX2Q9UBZ4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
APEX2Q9UBZ4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
APEX2Q9UBZ4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
APEX2Q9UBZ4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
APEX2Q9UBZ4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
APEX2Q9UBZ4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
APEX2Q9UBZ4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
APEX2Q9UBZ4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
APEX2Q9UBZ4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
APEX2Q9UBZ4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
APEX2Q9UBZ4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
APEX2Q9UBZ4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
APEX2Q9UBZ4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
APEX2Q9UBZ4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
APEX2Q9UBZ4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
APEX2Q9UBZ4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
APEX2Q9UBZ4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
APEX2Q9UBZ4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
APEX2Q9UBZ4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms