Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ71

RTEL1, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1Q9NZ71 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RTEL1Q9NZ71 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RTEL1Q9NZ71 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RTEL1Q9NZ71 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RTEL1Q9NZ71 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RTEL1Q9NZ71 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RTEL1Q9NZ71 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RTEL1Q9NZ71 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RTEL1Q9NZ71 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RTEL1Q9NZ71 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RTEL1Q9NZ71 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.57■■■□□ 2
RTEL1Q9NZ71 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
RTEL1Q9NZ71 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RTEL1Q9NZ71 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RTEL1Q9NZ71 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RTEL1Q9NZ71 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.56■■■□□ 2
RTEL1Q9NZ71 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RTEL1Q9NZ71 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RTEL1Q9NZ71 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RTEL1Q9NZ71 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RTEL1Q9NZ71 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RTEL1Q9NZ71 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RTEL1Q9NZ71 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.55■■■□□ 2
RTEL1Q9NZ71 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
RTEL1Q9NZ71 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RTEL1Q9NZ71 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RTEL1Q9NZ71 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RTEL1Q9NZ71 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RTEL1Q9NZ71 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RTEL1Q9NZ71 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RTEL1Q9NZ71 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RTEL1Q9NZ71 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
RTEL1Q9NZ71 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
RTEL1Q9NZ71 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.53■■■□□ 2
RTEL1Q9NZ71 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RTEL1Q9NZ71 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RTEL1Q9NZ71 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
RTEL1Q9NZ71 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RTEL1Q9NZ71 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RTEL1Q9NZ71 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RTEL1Q9NZ71 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.53■■■□□ 2
RTEL1Q9NZ71 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RTEL1Q9NZ71 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RTEL1Q9NZ71 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RTEL1Q9NZ71 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RTEL1Q9NZ71 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RTEL1Q9NZ71 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RTEL1Q9NZ71 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RTEL1Q9NZ71 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RTEL1Q9NZ71 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RTEL1Q9NZ71 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RTEL1Q9NZ71 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RTEL1Q9NZ71 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RTEL1Q9NZ71 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RTEL1Q9NZ71 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RTEL1Q9NZ71 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RTEL1Q9NZ71 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RTEL1Q9NZ71 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RTEL1Q9NZ71 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RTEL1Q9NZ71 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RTEL1Q9NZ71 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RTEL1Q9NZ71 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RTEL1Q9NZ71 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RTEL1Q9NZ71 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RTEL1Q9NZ71 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RTEL1Q9NZ71 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
RTEL1Q9NZ71 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RTEL1Q9NZ71 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RTEL1Q9NZ71 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
RTEL1Q9NZ71 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
RTEL1Q9NZ71 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RTEL1Q9NZ71 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RTEL1Q9NZ71 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RTEL1Q9NZ71 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RTEL1Q9NZ71 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RTEL1Q9NZ71 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RTEL1Q9NZ71 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RTEL1Q9NZ71 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RTEL1Q9NZ71 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RTEL1Q9NZ71 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RTEL1Q9NZ71 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RTEL1Q9NZ71 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RTEL1Q9NZ71 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RTEL1Q9NZ71 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RTEL1Q9NZ71 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RTEL1Q9NZ71 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RTEL1Q9NZ71 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
RTEL1Q9NZ71 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
RTEL1Q9NZ71 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RTEL1Q9NZ71 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
RTEL1Q9NZ71 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RTEL1Q9NZ71 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RTEL1Q9NZ71 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RTEL1Q9NZ71 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RTEL1Q9NZ71 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RTEL1Q9NZ71 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
RTEL1Q9NZ71 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RTEL1Q9NZ71 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RTEL1Q9NZ71 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RTEL1Q9NZ71 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms