Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYJ1

COA4, Cytochrome c oxidase assembly factor 4 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COA4Q9NYJ1 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
COA4Q9NYJ1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
COA4Q9NYJ1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
COA4Q9NYJ1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COA4Q9NYJ1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COA4Q9NYJ1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COA4Q9NYJ1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COA4Q9NYJ1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COA4Q9NYJ1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COA4Q9NYJ1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
COA4Q9NYJ1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COA4Q9NYJ1 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
COA4Q9NYJ1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
COA4Q9NYJ1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COA4Q9NYJ1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
COA4Q9NYJ1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
COA4Q9NYJ1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
COA4Q9NYJ1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COA4Q9NYJ1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COA4Q9NYJ1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
COA4Q9NYJ1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COA4Q9NYJ1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COA4Q9NYJ1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COA4Q9NYJ1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
COA4Q9NYJ1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COA4Q9NYJ1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COA4Q9NYJ1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
COA4Q9NYJ1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COA4Q9NYJ1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
COA4Q9NYJ1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
COA4Q9NYJ1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
COA4Q9NYJ1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COA4Q9NYJ1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COA4Q9NYJ1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COA4Q9NYJ1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COA4Q9NYJ1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COA4Q9NYJ1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COA4Q9NYJ1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COA4Q9NYJ1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COA4Q9NYJ1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COA4Q9NYJ1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COA4Q9NYJ1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COA4Q9NYJ1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COA4Q9NYJ1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COA4Q9NYJ1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COA4Q9NYJ1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COA4Q9NYJ1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
COA4Q9NYJ1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
COA4Q9NYJ1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
COA4Q9NYJ1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
COA4Q9NYJ1 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
COA4Q9NYJ1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
COA4Q9NYJ1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
COA4Q9NYJ1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
COA4Q9NYJ1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
COA4Q9NYJ1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
COA4Q9NYJ1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
COA4Q9NYJ1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COA4Q9NYJ1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COA4Q9NYJ1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COA4Q9NYJ1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COA4Q9NYJ1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COA4Q9NYJ1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
COA4Q9NYJ1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
COA4Q9NYJ1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COA4Q9NYJ1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COA4Q9NYJ1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COA4Q9NYJ1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COA4Q9NYJ1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COA4Q9NYJ1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COA4Q9NYJ1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COA4Q9NYJ1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COA4Q9NYJ1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
COA4Q9NYJ1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
COA4Q9NYJ1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COA4Q9NYJ1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
COA4Q9NYJ1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COA4Q9NYJ1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COA4Q9NYJ1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COA4Q9NYJ1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
COA4Q9NYJ1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
COA4Q9NYJ1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COA4Q9NYJ1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COA4Q9NYJ1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COA4Q9NYJ1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COA4Q9NYJ1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COA4Q9NYJ1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COA4Q9NYJ1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COA4Q9NYJ1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
COA4Q9NYJ1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COA4Q9NYJ1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COA4Q9NYJ1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COA4Q9NYJ1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COA4Q9NYJ1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COA4Q9NYJ1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COA4Q9NYJ1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COA4Q9NYJ1 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COA4Q9NYJ1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COA4Q9NYJ1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COA4Q9NYJ1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms