Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYA1

SPHK1, Sphingosine kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK1Q9NYA1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPHK1Q9NYA1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPHK1Q9NYA1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPHK1Q9NYA1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPHK1Q9NYA1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SPHK1Q9NYA1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPHK1Q9NYA1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPHK1Q9NYA1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPHK1Q9NYA1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPHK1Q9NYA1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPHK1Q9NYA1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPHK1Q9NYA1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPHK1Q9NYA1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPHK1Q9NYA1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPHK1Q9NYA1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPHK1Q9NYA1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPHK1Q9NYA1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPHK1Q9NYA1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPHK1Q9NYA1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPHK1Q9NYA1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPHK1Q9NYA1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPHK1Q9NYA1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPHK1Q9NYA1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPHK1Q9NYA1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPHK1Q9NYA1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPHK1Q9NYA1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPHK1Q9NYA1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPHK1Q9NYA1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPHK1Q9NYA1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPHK1Q9NYA1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPHK1Q9NYA1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPHK1Q9NYA1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPHK1Q9NYA1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPHK1Q9NYA1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPHK1Q9NYA1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPHK1Q9NYA1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPHK1Q9NYA1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPHK1Q9NYA1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SPHK1Q9NYA1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPHK1Q9NYA1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPHK1Q9NYA1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPHK1Q9NYA1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPHK1Q9NYA1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPHK1Q9NYA1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SPHK1Q9NYA1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPHK1Q9NYA1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPHK1Q9NYA1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPHK1Q9NYA1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPHK1Q9NYA1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPHK1Q9NYA1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPHK1Q9NYA1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPHK1Q9NYA1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPHK1Q9NYA1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SPHK1Q9NYA1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SPHK1Q9NYA1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SPHK1Q9NYA1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPHK1Q9NYA1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPHK1Q9NYA1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPHK1Q9NYA1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPHK1Q9NYA1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPHK1Q9NYA1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPHK1Q9NYA1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPHK1Q9NYA1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPHK1Q9NYA1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPHK1Q9NYA1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPHK1Q9NYA1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPHK1Q9NYA1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPHK1Q9NYA1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPHK1Q9NYA1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPHK1Q9NYA1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPHK1Q9NYA1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SPHK1Q9NYA1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPHK1Q9NYA1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPHK1Q9NYA1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPHK1Q9NYA1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPHK1Q9NYA1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPHK1Q9NYA1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPHK1Q9NYA1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPHK1Q9NYA1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPHK1Q9NYA1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPHK1Q9NYA1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPHK1Q9NYA1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPHK1Q9NYA1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPHK1Q9NYA1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPHK1Q9NYA1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPHK1Q9NYA1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SPHK1Q9NYA1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPHK1Q9NYA1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPHK1Q9NYA1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPHK1Q9NYA1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPHK1Q9NYA1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPHK1Q9NYA1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPHK1Q9NYA1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPHK1Q9NYA1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPHK1Q9NYA1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPHK1Q9NYA1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPHK1Q9NYA1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SPHK1Q9NYA1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPHK1Q9NYA1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPHK1Q9NYA1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.3 ms