Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS68

TNFRSF19, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 19, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF19Q9NS68 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TNFRSF19Q9NS68 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TNFRSF19Q9NS68 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TNFRSF19Q9NS68 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TNFRSF19Q9NS68 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TNFRSF19Q9NS68 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
TNFRSF19Q9NS68 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TNFRSF19Q9NS68 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TNFRSF19Q9NS68 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TNFRSF19Q9NS68 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TNFRSF19Q9NS68 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TNFRSF19Q9NS68 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TNFRSF19Q9NS68 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
TNFRSF19Q9NS68 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TNFRSF19Q9NS68 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TNFRSF19Q9NS68 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
TNFRSF19Q9NS68 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
TNFRSF19Q9NS68 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TNFRSF19Q9NS68 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TNFRSF19Q9NS68 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TNFRSF19Q9NS68 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TNFRSF19Q9NS68 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TNFRSF19Q9NS68 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TNFRSF19Q9NS68 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TNFRSF19Q9NS68 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TNFRSF19Q9NS68 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TNFRSF19Q9NS68 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TNFRSF19Q9NS68 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TNFRSF19Q9NS68 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TNFRSF19Q9NS68 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TNFRSF19Q9NS68 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TNFRSF19Q9NS68 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TNFRSF19Q9NS68 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TNFRSF19Q9NS68 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TNFRSF19Q9NS68 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TNFRSF19Q9NS68 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TNFRSF19Q9NS68 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TNFRSF19Q9NS68 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TNFRSF19Q9NS68 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TNFRSF19Q9NS68 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TNFRSF19Q9NS68 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TNFRSF19Q9NS68 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TNFRSF19Q9NS68 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TNFRSF19Q9NS68 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TNFRSF19Q9NS68 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TNFRSF19Q9NS68 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TNFRSF19Q9NS68 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TNFRSF19Q9NS68 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TNFRSF19Q9NS68 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TNFRSF19Q9NS68 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TNFRSF19Q9NS68 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TNFRSF19Q9NS68 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TNFRSF19Q9NS68 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TNFRSF19Q9NS68 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TNFRSF19Q9NS68 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TNFRSF19Q9NS68 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TNFRSF19Q9NS68 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TNFRSF19Q9NS68 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TNFRSF19Q9NS68 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TNFRSF19Q9NS68 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TNFRSF19Q9NS68 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TNFRSF19Q9NS68 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TNFRSF19Q9NS68 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TNFRSF19Q9NS68 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TNFRSF19Q9NS68 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TNFRSF19Q9NS68 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TNFRSF19Q9NS68 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TNFRSF19Q9NS68 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TNFRSF19Q9NS68 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TNFRSF19Q9NS68 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TNFRSF19Q9NS68 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TNFRSF19Q9NS68 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TNFRSF19Q9NS68 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TNFRSF19Q9NS68 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TNFRSF19Q9NS68 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TNFRSF19Q9NS68 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TNFRSF19Q9NS68 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TNFRSF19Q9NS68 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TNFRSF19Q9NS68 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TNFRSF19Q9NS68 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TNFRSF19Q9NS68 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TNFRSF19Q9NS68 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TNFRSF19Q9NS68 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TNFRSF19Q9NS68 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TNFRSF19Q9NS68 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TNFRSF19Q9NS68 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TNFRSF19Q9NS68 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TNFRSF19Q9NS68 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TNFRSF19Q9NS68 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TNFRSF19Q9NS68 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TNFRSF19Q9NS68 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TNFRSF19Q9NS68 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TNFRSF19Q9NS68 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TNFRSF19Q9NS68 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TNFRSF19Q9NS68 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TNFRSF19Q9NS68 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TNFRSF19Q9NS68 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TNFRSF19Q9NS68 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TNFRSF19Q9NS68 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TNFRSF19Q9NS68 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms