Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX2

MRPL17, 39S ribosomal protein L17, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL17Q9NRX2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MRPL17Q9NRX2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MRPL17Q9NRX2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MRPL17Q9NRX2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MRPL17Q9NRX2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
MRPL17Q9NRX2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MRPL17Q9NRX2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MRPL17Q9NRX2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MRPL17Q9NRX2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MRPL17Q9NRX2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MRPL17Q9NRX2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MRPL17Q9NRX2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MRPL17Q9NRX2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MRPL17Q9NRX2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MRPL17Q9NRX2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MRPL17Q9NRX2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MRPL17Q9NRX2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MRPL17Q9NRX2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MRPL17Q9NRX2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRPL17Q9NRX2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRPL17Q9NRX2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
MRPL17Q9NRX2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRPL17Q9NRX2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MRPL17Q9NRX2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MRPL17Q9NRX2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MRPL17Q9NRX2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MRPL17Q9NRX2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MRPL17Q9NRX2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MRPL17Q9NRX2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MRPL17Q9NRX2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MRPL17Q9NRX2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MRPL17Q9NRX2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MRPL17Q9NRX2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MRPL17Q9NRX2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MRPL17Q9NRX2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MRPL17Q9NRX2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MRPL17Q9NRX2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MRPL17Q9NRX2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MRPL17Q9NRX2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MRPL17Q9NRX2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MRPL17Q9NRX2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MRPL17Q9NRX2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MRPL17Q9NRX2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MRPL17Q9NRX2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MRPL17Q9NRX2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MRPL17Q9NRX2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
MRPL17Q9NRX2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MRPL17Q9NRX2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MRPL17Q9NRX2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MRPL17Q9NRX2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MRPL17Q9NRX2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MRPL17Q9NRX2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MRPL17Q9NRX2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MRPL17Q9NRX2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MRPL17Q9NRX2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MRPL17Q9NRX2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MRPL17Q9NRX2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MRPL17Q9NRX2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MRPL17Q9NRX2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MRPL17Q9NRX2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MRPL17Q9NRX2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MRPL17Q9NRX2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MRPL17Q9NRX2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MRPL17Q9NRX2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MRPL17Q9NRX2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
MRPL17Q9NRX2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MRPL17Q9NRX2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MRPL17Q9NRX2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MRPL17Q9NRX2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MRPL17Q9NRX2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MRPL17Q9NRX2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MRPL17Q9NRX2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MRPL17Q9NRX2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MRPL17Q9NRX2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MRPL17Q9NRX2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MRPL17Q9NRX2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MRPL17Q9NRX2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MRPL17Q9NRX2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MRPL17Q9NRX2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MRPL17Q9NRX2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MRPL17Q9NRX2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MRPL17Q9NRX2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
MRPL17Q9NRX2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
MRPL17Q9NRX2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
MRPL17Q9NRX2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
MRPL17Q9NRX2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MRPL17Q9NRX2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MRPL17Q9NRX2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MRPL17Q9NRX2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MRPL17Q9NRX2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MRPL17Q9NRX2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MRPL17Q9NRX2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MRPL17Q9NRX2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MRPL17Q9NRX2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MRPL17Q9NRX2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
MRPL17Q9NRX2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MRPL17Q9NRX2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MRPL17Q9NRX2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MRPL17Q9NRX2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MRPL17Q9NRX2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms