Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC8

SIX2, Homeobox protein SIX2, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX2Q9NPC8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SIX2Q9NPC8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SIX2Q9NPC8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SIX2Q9NPC8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SIX2Q9NPC8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SIX2Q9NPC8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SIX2Q9NPC8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SIX2Q9NPC8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SIX2Q9NPC8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SIX2Q9NPC8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SIX2Q9NPC8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SIX2Q9NPC8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SIX2Q9NPC8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SIX2Q9NPC8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SIX2Q9NPC8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SIX2Q9NPC8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SIX2Q9NPC8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SIX2Q9NPC8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SIX2Q9NPC8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SIX2Q9NPC8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SIX2Q9NPC8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SIX2Q9NPC8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SIX2Q9NPC8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SIX2Q9NPC8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SIX2Q9NPC8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SIX2Q9NPC8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SIX2Q9NPC8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SIX2Q9NPC8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SIX2Q9NPC8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SIX2Q9NPC8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SIX2Q9NPC8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SIX2Q9NPC8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SIX2Q9NPC8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SIX2Q9NPC8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SIX2Q9NPC8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SIX2Q9NPC8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SIX2Q9NPC8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SIX2Q9NPC8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SIX2Q9NPC8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SIX2Q9NPC8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SIX2Q9NPC8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SIX2Q9NPC8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SIX2Q9NPC8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SIX2Q9NPC8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SIX2Q9NPC8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SIX2Q9NPC8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SIX2Q9NPC8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SIX2Q9NPC8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SIX2Q9NPC8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SIX2Q9NPC8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SIX2Q9NPC8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SIX2Q9NPC8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SIX2Q9NPC8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SIX2Q9NPC8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SIX2Q9NPC8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SIX2Q9NPC8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SIX2Q9NPC8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SIX2Q9NPC8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SIX2Q9NPC8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SIX2Q9NPC8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SIX2Q9NPC8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SIX2Q9NPC8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SIX2Q9NPC8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SIX2Q9NPC8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SIX2Q9NPC8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SIX2Q9NPC8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SIX2Q9NPC8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SIX2Q9NPC8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SIX2Q9NPC8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SIX2Q9NPC8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SIX2Q9NPC8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SIX2Q9NPC8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SIX2Q9NPC8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SIX2Q9NPC8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SIX2Q9NPC8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SIX2Q9NPC8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SIX2Q9NPC8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SIX2Q9NPC8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SIX2Q9NPC8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SIX2Q9NPC8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SIX2Q9NPC8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SIX2Q9NPC8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SIX2Q9NPC8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SIX2Q9NPC8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SIX2Q9NPC8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SIX2Q9NPC8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SIX2Q9NPC8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SIX2Q9NPC8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SIX2Q9NPC8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SIX2Q9NPC8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SIX2Q9NPC8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SIX2Q9NPC8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SIX2Q9NPC8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SIX2Q9NPC8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SIX2Q9NPC8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SIX2Q9NPC8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SIX2Q9NPC8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SIX2Q9NPC8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SIX2Q9NPC8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SIX2Q9NPC8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms