Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP59

SLC40A1, Solute carrier family 40 member 1, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC40A1Q9NP59 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC40A1Q9NP59 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC40A1Q9NP59 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC40A1Q9NP59 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC40A1Q9NP59 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC40A1Q9NP59 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC40A1Q9NP59 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC40A1Q9NP59 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC40A1Q9NP59 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC40A1Q9NP59 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC40A1Q9NP59 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC40A1Q9NP59 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC40A1Q9NP59 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC40A1Q9NP59 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC40A1Q9NP59 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC40A1Q9NP59 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC40A1Q9NP59 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC40A1Q9NP59 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC40A1Q9NP59 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC40A1Q9NP59 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC40A1Q9NP59 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC40A1Q9NP59 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC40A1Q9NP59 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC40A1Q9NP59 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC40A1Q9NP59 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC40A1Q9NP59 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC40A1Q9NP59 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC40A1Q9NP59 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC40A1Q9NP59 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC40A1Q9NP59 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC40A1Q9NP59 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC40A1Q9NP59 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC40A1Q9NP59 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC40A1Q9NP59 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC40A1Q9NP59 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC40A1Q9NP59 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC40A1Q9NP59 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC40A1Q9NP59 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC40A1Q9NP59 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC40A1Q9NP59 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC40A1Q9NP59 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC40A1Q9NP59 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC40A1Q9NP59 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC40A1Q9NP59 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC40A1Q9NP59 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC40A1Q9NP59 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC40A1Q9NP59 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC40A1Q9NP59 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC40A1Q9NP59 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC40A1Q9NP59 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC40A1Q9NP59 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC40A1Q9NP59 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC40A1Q9NP59 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC40A1Q9NP59 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC40A1Q9NP59 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC40A1Q9NP59 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC40A1Q9NP59 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC40A1Q9NP59 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC40A1Q9NP59 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC40A1Q9NP59 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC40A1Q9NP59 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC40A1Q9NP59 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC40A1Q9NP59 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC40A1Q9NP59 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC40A1Q9NP59 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC40A1Q9NP59 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC40A1Q9NP59 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC40A1Q9NP59 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC40A1Q9NP59 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC40A1Q9NP59 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC40A1Q9NP59 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC40A1Q9NP59 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC40A1Q9NP59 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC40A1Q9NP59 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC40A1Q9NP59 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC40A1Q9NP59 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC40A1Q9NP59 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC40A1Q9NP59 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC40A1Q9NP59 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC40A1Q9NP59 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC40A1Q9NP59 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC40A1Q9NP59 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC40A1Q9NP59 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SLC40A1Q9NP59 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC40A1Q9NP59 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC40A1Q9NP59 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC40A1Q9NP59 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC40A1Q9NP59 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC40A1Q9NP59 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC40A1Q9NP59 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC40A1Q9NP59 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC40A1Q9NP59 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC40A1Q9NP59 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC40A1Q9NP59 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC40A1Q9NP59 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC40A1Q9NP59 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC40A1Q9NP59 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC40A1Q9NP59 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC40A1Q9NP59 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC40A1Q9NP59 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 181.7 ms