Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNX9

VCX3A, Variable charge X-linked protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCX3AQ9NNX9 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VCX3AQ9NNX9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
VCX3AQ9NNX9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VCX3AQ9NNX9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VCX3AQ9NNX9 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VCX3AQ9NNX9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VCX3AQ9NNX9 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VCX3AQ9NNX9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VCX3AQ9NNX9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VCX3AQ9NNX9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VCX3AQ9NNX9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VCX3AQ9NNX9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VCX3AQ9NNX9 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VCX3AQ9NNX9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VCX3AQ9NNX9 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VCX3AQ9NNX9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VCX3AQ9NNX9 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VCX3AQ9NNX9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VCX3AQ9NNX9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VCX3AQ9NNX9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VCX3AQ9NNX9 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VCX3AQ9NNX9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VCX3AQ9NNX9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VCX3AQ9NNX9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VCX3AQ9NNX9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VCX3AQ9NNX9 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VCX3AQ9NNX9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VCX3AQ9NNX9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VCX3AQ9NNX9 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VCX3AQ9NNX9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VCX3AQ9NNX9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VCX3AQ9NNX9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VCX3AQ9NNX9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VCX3AQ9NNX9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VCX3AQ9NNX9 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VCX3AQ9NNX9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VCX3AQ9NNX9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VCX3AQ9NNX9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VCX3AQ9NNX9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VCX3AQ9NNX9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VCX3AQ9NNX9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VCX3AQ9NNX9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VCX3AQ9NNX9 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VCX3AQ9NNX9 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VCX3AQ9NNX9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
VCX3AQ9NNX9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VCX3AQ9NNX9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
VCX3AQ9NNX9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VCX3AQ9NNX9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VCX3AQ9NNX9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VCX3AQ9NNX9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VCX3AQ9NNX9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VCX3AQ9NNX9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VCX3AQ9NNX9 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
VCX3AQ9NNX9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
VCX3AQ9NNX9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VCX3AQ9NNX9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VCX3AQ9NNX9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VCX3AQ9NNX9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VCX3AQ9NNX9 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VCX3AQ9NNX9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VCX3AQ9NNX9 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VCX3AQ9NNX9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VCX3AQ9NNX9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VCX3AQ9NNX9 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VCX3AQ9NNX9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VCX3AQ9NNX9 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VCX3AQ9NNX9 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VCX3AQ9NNX9 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VCX3AQ9NNX9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VCX3AQ9NNX9 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VCX3AQ9NNX9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
VCX3AQ9NNX9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VCX3AQ9NNX9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VCX3AQ9NNX9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VCX3AQ9NNX9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VCX3AQ9NNX9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VCX3AQ9NNX9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VCX3AQ9NNX9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VCX3AQ9NNX9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VCX3AQ9NNX9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VCX3AQ9NNX9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VCX3AQ9NNX9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VCX3AQ9NNX9 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VCX3AQ9NNX9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VCX3AQ9NNX9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VCX3AQ9NNX9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VCX3AQ9NNX9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
VCX3AQ9NNX9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
VCX3AQ9NNX9 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VCX3AQ9NNX9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VCX3AQ9NNX9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VCX3AQ9NNX9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VCX3AQ9NNX9 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VCX3AQ9NNX9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VCX3AQ9NNX9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
VCX3AQ9NNX9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VCX3AQ9NNX9 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VCX3AQ9NNX9 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VCX3AQ9NNX9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.5 ms