Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS5

EPB41L4A, Band 4.1-like protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41L4AQ9HCS5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
EPB41L4AQ9HCS5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
EPB41L4AQ9HCS5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
EPB41L4AQ9HCS5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
EPB41L4AQ9HCS5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
EPB41L4AQ9HCS5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
EPB41L4AQ9HCS5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
EPB41L4AQ9HCS5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
EPB41L4AQ9HCS5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
EPB41L4AQ9HCS5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
EPB41L4AQ9HCS5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
EPB41L4AQ9HCS5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
EPB41L4AQ9HCS5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
EPB41L4AQ9HCS5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
EPB41L4AQ9HCS5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
EPB41L4AQ9HCS5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
EPB41L4AQ9HCS5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
EPB41L4AQ9HCS5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
EPB41L4AQ9HCS5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
EPB41L4AQ9HCS5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
EPB41L4AQ9HCS5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
EPB41L4AQ9HCS5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
EPB41L4AQ9HCS5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
EPB41L4AQ9HCS5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
EPB41L4AQ9HCS5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
EPB41L4AQ9HCS5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
EPB41L4AQ9HCS5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
EPB41L4AQ9HCS5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
EPB41L4AQ9HCS5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
EPB41L4AQ9HCS5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
EPB41L4AQ9HCS5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
EPB41L4AQ9HCS5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
EPB41L4AQ9HCS5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
EPB41L4AQ9HCS5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
EPB41L4AQ9HCS5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
EPB41L4AQ9HCS5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
EPB41L4AQ9HCS5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
EPB41L4AQ9HCS5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
EPB41L4AQ9HCS5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
EPB41L4AQ9HCS5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
EPB41L4AQ9HCS5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
EPB41L4AQ9HCS5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
EPB41L4AQ9HCS5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
EPB41L4AQ9HCS5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
EPB41L4AQ9HCS5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
EPB41L4AQ9HCS5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
EPB41L4AQ9HCS5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
EPB41L4AQ9HCS5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
EPB41L4AQ9HCS5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
EPB41L4AQ9HCS5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
EPB41L4AQ9HCS5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
EPB41L4AQ9HCS5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
EPB41L4AQ9HCS5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
EPB41L4AQ9HCS5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
EPB41L4AQ9HCS5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
EPB41L4AQ9HCS5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
EPB41L4AQ9HCS5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
EPB41L4AQ9HCS5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
EPB41L4AQ9HCS5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
EPB41L4AQ9HCS5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
EPB41L4AQ9HCS5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
EPB41L4AQ9HCS5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
EPB41L4AQ9HCS5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
EPB41L4AQ9HCS5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
EPB41L4AQ9HCS5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
EPB41L4AQ9HCS5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
EPB41L4AQ9HCS5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
EPB41L4AQ9HCS5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
EPB41L4AQ9HCS5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
EPB41L4AQ9HCS5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
EPB41L4AQ9HCS5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
EPB41L4AQ9HCS5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
EPB41L4AQ9HCS5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
EPB41L4AQ9HCS5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
EPB41L4AQ9HCS5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
EPB41L4AQ9HCS5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
EPB41L4AQ9HCS5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
EPB41L4AQ9HCS5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
EPB41L4AQ9HCS5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
EPB41L4AQ9HCS5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
EPB41L4AQ9HCS5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
EPB41L4AQ9HCS5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
EPB41L4AQ9HCS5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
EPB41L4AQ9HCS5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
EPB41L4AQ9HCS5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
EPB41L4AQ9HCS5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
EPB41L4AQ9HCS5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
EPB41L4AQ9HCS5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
EPB41L4AQ9HCS5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
EPB41L4AQ9HCS5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
EPB41L4AQ9HCS5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
EPB41L4AQ9HCS5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
EPB41L4AQ9HCS5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
EPB41L4AQ9HCS5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
EPB41L4AQ9HCS5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
EPB41L4AQ9HCS5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
EPB41L4AQ9HCS5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
EPB41L4AQ9HCS5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
EPB41L4AQ9HCS5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
EPB41L4AQ9HCS5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms