Protein–RNA interactions for Protein: Q9C098

DCLK3, Serine/threonine-protein kinase DCLK3, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLK3Q9C098 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DCLK3Q9C098 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DCLK3Q9C098 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
DCLK3Q9C098 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DCLK3Q9C098 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DCLK3Q9C098 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DCLK3Q9C098 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DCLK3Q9C098 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DCLK3Q9C098 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DCLK3Q9C098 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
DCLK3Q9C098 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DCLK3Q9C098 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DCLK3Q9C098 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DCLK3Q9C098 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DCLK3Q9C098 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DCLK3Q9C098 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DCLK3Q9C098 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
DCLK3Q9C098 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DCLK3Q9C098 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DCLK3Q9C098 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DCLK3Q9C098 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DCLK3Q9C098 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DCLK3Q9C098 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DCLK3Q9C098 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
DCLK3Q9C098 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DCLK3Q9C098 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
DCLK3Q9C098 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DCLK3Q9C098 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DCLK3Q9C098 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DCLK3Q9C098 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DCLK3Q9C098 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DCLK3Q9C098 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DCLK3Q9C098 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DCLK3Q9C098 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DCLK3Q9C098 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DCLK3Q9C098 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DCLK3Q9C098 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DCLK3Q9C098 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DCLK3Q9C098 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DCLK3Q9C098 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DCLK3Q9C098 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DCLK3Q9C098 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DCLK3Q9C098 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DCLK3Q9C098 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DCLK3Q9C098 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DCLK3Q9C098 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DCLK3Q9C098 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DCLK3Q9C098 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
DCLK3Q9C098 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DCLK3Q9C098 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DCLK3Q9C098 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DCLK3Q9C098 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DCLK3Q9C098 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DCLK3Q9C098 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DCLK3Q9C098 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DCLK3Q9C098 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DCLK3Q9C098 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DCLK3Q9C098 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DCLK3Q9C098 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DCLK3Q9C098 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DCLK3Q9C098 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DCLK3Q9C098 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DCLK3Q9C098 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DCLK3Q9C098 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DCLK3Q9C098 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DCLK3Q9C098 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DCLK3Q9C098 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DCLK3Q9C098 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DCLK3Q9C098 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DCLK3Q9C098 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DCLK3Q9C098 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
DCLK3Q9C098 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DCLK3Q9C098 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DCLK3Q9C098 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DCLK3Q9C098 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DCLK3Q9C098 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DCLK3Q9C098 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DCLK3Q9C098 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
DCLK3Q9C098 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DCLK3Q9C098 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25■■□□□ 1.59
DCLK3Q9C098 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25■■□□□ 1.59
DCLK3Q9C098 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
DCLK3Q9C098 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DCLK3Q9C098 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DCLK3Q9C098 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25■■□□□ 1.59
DCLK3Q9C098 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DCLK3Q9C098 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DCLK3Q9C098 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DCLK3Q9C098 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DCLK3Q9C098 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DCLK3Q9C098 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DCLK3Q9C098 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DCLK3Q9C098 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
DCLK3Q9C098 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DCLK3Q9C098 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DCLK3Q9C098 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DCLK3Q9C098 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DCLK3Q9C098 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DCLK3Q9C098 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DCLK3Q9C098 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms