Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
PCGF6Q9BYE7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
PCGF6Q9BYE7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
PCGF6Q9BYE7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
PCGF6Q9BYE7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
PCGF6Q9BYE7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
PCGF6Q9BYE7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
PCGF6Q9BYE7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
PCGF6Q9BYE7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
PCGF6Q9BYE7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
PCGF6Q9BYE7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
PCGF6Q9BYE7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC36.73■■■■□ 3.47
PCGF6Q9BYE7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
PCGF6Q9BYE7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
PCGF6Q9BYE7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
PCGF6Q9BYE7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
PCGF6Q9BYE7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
PCGF6Q9BYE7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
PCGF6Q9BYE7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC36.71■■■■□ 3.47
PCGF6Q9BYE7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC36.71■■■■□ 3.47
PCGF6Q9BYE7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.71■■■■□ 3.47
PCGF6Q9BYE7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
PCGF6Q9BYE7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC36.7■■■■□ 3.47
PCGF6Q9BYE7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.7■■■■□ 3.47
PCGF6Q9BYE7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
PCGF6Q9BYE7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
PCGF6Q9BYE7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
PCGF6Q9BYE7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
PCGF6Q9BYE7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
PCGF6Q9BYE7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.69■■■■□ 3.46
PCGF6Q9BYE7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
PCGF6Q9BYE7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
PCGF6Q9BYE7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
PCGF6Q9BYE7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
PCGF6Q9BYE7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
PCGF6Q9BYE7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
PCGF6Q9BYE7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
PCGF6Q9BYE7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
PCGF6Q9BYE7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
PCGF6Q9BYE7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
PCGF6Q9BYE7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
PCGF6Q9BYE7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
PCGF6Q9BYE7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
PCGF6Q9BYE7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
PCGF6Q9BYE7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
PCGF6Q9BYE7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
PCGF6Q9BYE7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
PCGF6Q9BYE7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
PCGF6Q9BYE7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
PCGF6Q9BYE7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
PCGF6Q9BYE7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
PCGF6Q9BYE7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
PCGF6Q9BYE7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
PCGF6Q9BYE7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
PCGF6Q9BYE7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
PCGF6Q9BYE7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
PCGF6Q9BYE7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
PCGF6Q9BYE7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
PCGF6Q9BYE7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
PCGF6Q9BYE7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.46
PCGF6Q9BYE7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
PCGF6Q9BYE7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
PCGF6Q9BYE7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
PCGF6Q9BYE7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
PCGF6Q9BYE7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
PCGF6Q9BYE7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
PCGF6Q9BYE7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
PCGF6Q9BYE7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
PCGF6Q9BYE7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
PCGF6Q9BYE7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
PCGF6Q9BYE7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
PCGF6Q9BYE7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
PCGF6Q9BYE7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
PCGF6Q9BYE7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
PCGF6Q9BYE7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
PCGF6Q9BYE7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
PCGF6Q9BYE7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
PCGF6Q9BYE7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
PCGF6Q9BYE7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
PCGF6Q9BYE7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
PCGF6Q9BYE7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
PCGF6Q9BYE7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC36.59■■■■□ 3.45
PCGF6Q9BYE7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
PCGF6Q9BYE7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
PCGF6Q9BYE7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
PCGF6Q9BYE7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
PCGF6Q9BYE7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
PCGF6Q9BYE7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
PCGF6Q9BYE7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.45
PCGF6Q9BYE7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
PCGF6Q9BYE7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
PCGF6Q9BYE7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
PCGF6Q9BYE7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC36.57■■■■□ 3.44
PCGF6Q9BYE7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC36.57■■■■□ 3.44
PCGF6Q9BYE7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
PCGF6Q9BYE7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
PCGF6Q9BYE7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
PCGF6Q9BYE7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
PCGF6Q9BYE7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
PCGF6Q9BYE7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms