Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX79

STRA6, Stimulated by retinoic acid gene 6 protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRA6Q9BX79 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
STRA6Q9BX79 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
STRA6Q9BX79 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
STRA6Q9BX79 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
STRA6Q9BX79 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
STRA6Q9BX79 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
STRA6Q9BX79 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
STRA6Q9BX79 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
STRA6Q9BX79 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
STRA6Q9BX79 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
STRA6Q9BX79 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
STRA6Q9BX79 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
STRA6Q9BX79 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
STRA6Q9BX79 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
STRA6Q9BX79 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
STRA6Q9BX79 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
STRA6Q9BX79 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
STRA6Q9BX79 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
STRA6Q9BX79 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
STRA6Q9BX79 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
STRA6Q9BX79 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
STRA6Q9BX79 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
STRA6Q9BX79 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
STRA6Q9BX79 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
STRA6Q9BX79 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
STRA6Q9BX79 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
STRA6Q9BX79 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
STRA6Q9BX79 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
STRA6Q9BX79 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
STRA6Q9BX79 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
STRA6Q9BX79 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
STRA6Q9BX79 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
STRA6Q9BX79 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
STRA6Q9BX79 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
STRA6Q9BX79 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
STRA6Q9BX79 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
STRA6Q9BX79 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
STRA6Q9BX79 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
STRA6Q9BX79 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
STRA6Q9BX79 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
STRA6Q9BX79 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
STRA6Q9BX79 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
STRA6Q9BX79 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
STRA6Q9BX79 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
STRA6Q9BX79 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
STRA6Q9BX79 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
STRA6Q9BX79 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
STRA6Q9BX79 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
STRA6Q9BX79 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
STRA6Q9BX79 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
STRA6Q9BX79 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
STRA6Q9BX79 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
STRA6Q9BX79 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
STRA6Q9BX79 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
STRA6Q9BX79 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
STRA6Q9BX79 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
STRA6Q9BX79 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
STRA6Q9BX79 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
STRA6Q9BX79 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
STRA6Q9BX79 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
STRA6Q9BX79 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
STRA6Q9BX79 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
STRA6Q9BX79 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
STRA6Q9BX79 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
STRA6Q9BX79 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
STRA6Q9BX79 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
STRA6Q9BX79 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
STRA6Q9BX79 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
STRA6Q9BX79 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
STRA6Q9BX79 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
STRA6Q9BX79 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
STRA6Q9BX79 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
STRA6Q9BX79 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
STRA6Q9BX79 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
STRA6Q9BX79 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
STRA6Q9BX79 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
STRA6Q9BX79 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
STRA6Q9BX79 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
STRA6Q9BX79 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
STRA6Q9BX79 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
STRA6Q9BX79 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
STRA6Q9BX79 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
STRA6Q9BX79 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
STRA6Q9BX79 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
STRA6Q9BX79 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
STRA6Q9BX79 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
STRA6Q9BX79 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
STRA6Q9BX79 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
STRA6Q9BX79 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
STRA6Q9BX79 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
STRA6Q9BX79 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
STRA6Q9BX79 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26■■□□□ 1.75
STRA6Q9BX79 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
STRA6Q9BX79 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
STRA6Q9BX79 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26■■□□□ 1.75
STRA6Q9BX79 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
STRA6Q9BX79 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
STRA6Q9BX79 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
STRA6Q9BX79 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
STRA6Q9BX79 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms