Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX40

LSM14B, Protein LSM14 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM14BQ9BX40 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LSM14BQ9BX40 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LSM14BQ9BX40 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LSM14BQ9BX40 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LSM14BQ9BX40 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
LSM14BQ9BX40 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LSM14BQ9BX40 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LSM14BQ9BX40 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LSM14BQ9BX40 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LSM14BQ9BX40 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LSM14BQ9BX40 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LSM14BQ9BX40 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LSM14BQ9BX40 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LSM14BQ9BX40 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LSM14BQ9BX40 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LSM14BQ9BX40 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LSM14BQ9BX40 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LSM14BQ9BX40 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LSM14BQ9BX40 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LSM14BQ9BX40 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LSM14BQ9BX40 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LSM14BQ9BX40 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LSM14BQ9BX40 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LSM14BQ9BX40 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LSM14BQ9BX40 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LSM14BQ9BX40 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
LSM14BQ9BX40 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LSM14BQ9BX40 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LSM14BQ9BX40 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LSM14BQ9BX40 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LSM14BQ9BX40 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LSM14BQ9BX40 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LSM14BQ9BX40 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LSM14BQ9BX40 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LSM14BQ9BX40 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LSM14BQ9BX40 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LSM14BQ9BX40 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LSM14BQ9BX40 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LSM14BQ9BX40 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LSM14BQ9BX40 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LSM14BQ9BX40 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LSM14BQ9BX40 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
LSM14BQ9BX40 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LSM14BQ9BX40 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LSM14BQ9BX40 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LSM14BQ9BX40 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LSM14BQ9BX40 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LSM14BQ9BX40 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LSM14BQ9BX40 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LSM14BQ9BX40 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LSM14BQ9BX40 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LSM14BQ9BX40 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LSM14BQ9BX40 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LSM14BQ9BX40 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LSM14BQ9BX40 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LSM14BQ9BX40 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LSM14BQ9BX40 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LSM14BQ9BX40 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LSM14BQ9BX40 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LSM14BQ9BX40 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LSM14BQ9BX40 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LSM14BQ9BX40 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LSM14BQ9BX40 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LSM14BQ9BX40 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LSM14BQ9BX40 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LSM14BQ9BX40 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LSM14BQ9BX40 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LSM14BQ9BX40 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LSM14BQ9BX40 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LSM14BQ9BX40 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LSM14BQ9BX40 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LSM14BQ9BX40 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LSM14BQ9BX40 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LSM14BQ9BX40 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LSM14BQ9BX40 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LSM14BQ9BX40 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LSM14BQ9BX40 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LSM14BQ9BX40 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LSM14BQ9BX40 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LSM14BQ9BX40 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
LSM14BQ9BX40 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LSM14BQ9BX40 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
LSM14BQ9BX40 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LSM14BQ9BX40 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LSM14BQ9BX40 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LSM14BQ9BX40 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
LSM14BQ9BX40 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LSM14BQ9BX40 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LSM14BQ9BX40 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LSM14BQ9BX40 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LSM14BQ9BX40 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LSM14BQ9BX40 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LSM14BQ9BX40 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LSM14BQ9BX40 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LSM14BQ9BX40 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LSM14BQ9BX40 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LSM14BQ9BX40 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LSM14BQ9BX40 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LSM14BQ9BX40 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LSM14BQ9BX40 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms