Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRZ2

TRIM56, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM56, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM56Q9BRZ2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM56Q9BRZ2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM56Q9BRZ2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM56Q9BRZ2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM56Q9BRZ2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM56Q9BRZ2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM56Q9BRZ2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM56Q9BRZ2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM56Q9BRZ2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM56Q9BRZ2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM56Q9BRZ2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM56Q9BRZ2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM56Q9BRZ2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM56Q9BRZ2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM56Q9BRZ2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM56Q9BRZ2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM56Q9BRZ2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM56Q9BRZ2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM56Q9BRZ2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM56Q9BRZ2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM56Q9BRZ2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM56Q9BRZ2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM56Q9BRZ2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM56Q9BRZ2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM56Q9BRZ2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM56Q9BRZ2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM56Q9BRZ2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM56Q9BRZ2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM56Q9BRZ2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM56Q9BRZ2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM56Q9BRZ2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM56Q9BRZ2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM56Q9BRZ2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM56Q9BRZ2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
TRIM56Q9BRZ2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM56Q9BRZ2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM56Q9BRZ2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM56Q9BRZ2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM56Q9BRZ2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM56Q9BRZ2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM56Q9BRZ2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM56Q9BRZ2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM56Q9BRZ2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM56Q9BRZ2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM56Q9BRZ2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM56Q9BRZ2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM56Q9BRZ2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM56Q9BRZ2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM56Q9BRZ2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM56Q9BRZ2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM56Q9BRZ2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM56Q9BRZ2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM56Q9BRZ2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM56Q9BRZ2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM56Q9BRZ2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM56Q9BRZ2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM56Q9BRZ2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM56Q9BRZ2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM56Q9BRZ2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM56Q9BRZ2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM56Q9BRZ2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM56Q9BRZ2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM56Q9BRZ2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM56Q9BRZ2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM56Q9BRZ2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM56Q9BRZ2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM56Q9BRZ2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM56Q9BRZ2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM56Q9BRZ2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM56Q9BRZ2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM56Q9BRZ2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM56Q9BRZ2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM56Q9BRZ2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM56Q9BRZ2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM56Q9BRZ2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM56Q9BRZ2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM56Q9BRZ2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM56Q9BRZ2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM56Q9BRZ2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM56Q9BRZ2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM56Q9BRZ2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM56Q9BRZ2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM56Q9BRZ2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM56Q9BRZ2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM56Q9BRZ2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM56Q9BRZ2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM56Q9BRZ2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM56Q9BRZ2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM56Q9BRZ2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM56Q9BRZ2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM56Q9BRZ2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM56Q9BRZ2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM56Q9BRZ2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM56Q9BRZ2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM56Q9BRZ2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM56Q9BRZ2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM56Q9BRZ2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRIM56Q9BRZ2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM56Q9BRZ2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM56Q9BRZ2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms