Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRT7

LINC00467, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00467, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00467Q9BRT7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00467Q9BRT7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00467Q9BRT7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00467Q9BRT7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00467Q9BRT7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00467Q9BRT7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00467Q9BRT7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00467Q9BRT7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00467Q9BRT7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00467Q9BRT7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00467Q9BRT7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00467Q9BRT7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00467Q9BRT7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00467Q9BRT7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00467Q9BRT7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00467Q9BRT7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00467Q9BRT7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00467Q9BRT7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00467Q9BRT7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00467Q9BRT7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00467Q9BRT7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00467Q9BRT7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00467Q9BRT7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00467Q9BRT7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00467Q9BRT7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00467Q9BRT7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00467Q9BRT7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00467Q9BRT7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00467Q9BRT7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00467Q9BRT7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00467Q9BRT7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00467Q9BRT7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
LINC00467Q9BRT7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00467Q9BRT7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00467Q9BRT7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00467Q9BRT7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00467Q9BRT7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00467Q9BRT7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00467Q9BRT7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00467Q9BRT7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00467Q9BRT7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00467Q9BRT7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00467Q9BRT7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00467Q9BRT7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00467Q9BRT7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00467Q9BRT7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00467Q9BRT7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00467Q9BRT7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00467Q9BRT7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00467Q9BRT7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00467Q9BRT7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00467Q9BRT7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00467Q9BRT7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00467Q9BRT7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00467Q9BRT7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00467Q9BRT7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00467Q9BRT7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00467Q9BRT7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00467Q9BRT7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00467Q9BRT7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00467Q9BRT7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00467Q9BRT7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00467Q9BRT7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00467Q9BRT7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00467Q9BRT7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00467Q9BRT7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00467Q9BRT7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00467Q9BRT7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00467Q9BRT7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00467Q9BRT7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00467Q9BRT7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00467Q9BRT7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00467Q9BRT7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00467Q9BRT7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00467Q9BRT7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00467Q9BRT7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00467Q9BRT7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00467Q9BRT7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00467Q9BRT7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00467Q9BRT7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00467Q9BRT7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00467Q9BRT7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00467Q9BRT7 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00467Q9BRT7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00467Q9BRT7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00467Q9BRT7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00467Q9BRT7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00467Q9BRT7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00467Q9BRT7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00467Q9BRT7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00467Q9BRT7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00467Q9BRT7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00467Q9BRT7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00467Q9BRT7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
LINC00467Q9BRT7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00467Q9BRT7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00467Q9BRT7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00467Q9BRT7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00467Q9BRT7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00467Q9BRT7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms