Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK3

MXRA8, Matrix remodeling-associated protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MXRA8Q9BRK3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MXRA8Q9BRK3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MXRA8Q9BRK3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MXRA8Q9BRK3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MXRA8Q9BRK3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
MXRA8Q9BRK3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MXRA8Q9BRK3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MXRA8Q9BRK3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MXRA8Q9BRK3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MXRA8Q9BRK3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MXRA8Q9BRK3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MXRA8Q9BRK3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MXRA8Q9BRK3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MXRA8Q9BRK3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
MXRA8Q9BRK3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
MXRA8Q9BRK3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MXRA8Q9BRK3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MXRA8Q9BRK3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
MXRA8Q9BRK3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MXRA8Q9BRK3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MXRA8Q9BRK3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MXRA8Q9BRK3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MXRA8Q9BRK3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MXRA8Q9BRK3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MXRA8Q9BRK3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MXRA8Q9BRK3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MXRA8Q9BRK3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
MXRA8Q9BRK3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MXRA8Q9BRK3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
MXRA8Q9BRK3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MXRA8Q9BRK3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MXRA8Q9BRK3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MXRA8Q9BRK3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MXRA8Q9BRK3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MXRA8Q9BRK3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MXRA8Q9BRK3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MXRA8Q9BRK3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MXRA8Q9BRK3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
MXRA8Q9BRK3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MXRA8Q9BRK3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MXRA8Q9BRK3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MXRA8Q9BRK3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MXRA8Q9BRK3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MXRA8Q9BRK3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
MXRA8Q9BRK3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MXRA8Q9BRK3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MXRA8Q9BRK3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MXRA8Q9BRK3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MXRA8Q9BRK3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MXRA8Q9BRK3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MXRA8Q9BRK3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MXRA8Q9BRK3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MXRA8Q9BRK3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MXRA8Q9BRK3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MXRA8Q9BRK3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MXRA8Q9BRK3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MXRA8Q9BRK3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MXRA8Q9BRK3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MXRA8Q9BRK3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MXRA8Q9BRK3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MXRA8Q9BRK3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MXRA8Q9BRK3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MXRA8Q9BRK3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MXRA8Q9BRK3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MXRA8Q9BRK3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MXRA8Q9BRK3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MXRA8Q9BRK3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MXRA8Q9BRK3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MXRA8Q9BRK3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MXRA8Q9BRK3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MXRA8Q9BRK3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
MXRA8Q9BRK3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
MXRA8Q9BRK3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MXRA8Q9BRK3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
MXRA8Q9BRK3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MXRA8Q9BRK3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MXRA8Q9BRK3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MXRA8Q9BRK3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MXRA8Q9BRK3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MXRA8Q9BRK3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MXRA8Q9BRK3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MXRA8Q9BRK3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MXRA8Q9BRK3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
MXRA8Q9BRK3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MXRA8Q9BRK3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MXRA8Q9BRK3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MXRA8Q9BRK3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MXRA8Q9BRK3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MXRA8Q9BRK3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MXRA8Q9BRK3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MXRA8Q9BRK3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MXRA8Q9BRK3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MXRA8Q9BRK3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MXRA8Q9BRK3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MXRA8Q9BRK3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MXRA8Q9BRK3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MXRA8Q9BRK3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MXRA8Q9BRK3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MXRA8Q9BRK3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MXRA8Q9BRK3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
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