Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLF1Q9BQI6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLF1Q9BQI6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLF1Q9BQI6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLF1Q9BQI6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLF1Q9BQI6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLF1Q9BQI6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLF1Q9BQI6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLF1Q9BQI6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLF1Q9BQI6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLF1Q9BQI6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLF1Q9BQI6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLF1Q9BQI6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SLF1Q9BQI6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SLF1Q9BQI6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLF1Q9BQI6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLF1Q9BQI6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLF1Q9BQI6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLF1Q9BQI6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLF1Q9BQI6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLF1Q9BQI6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLF1Q9BQI6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SLF1Q9BQI6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLF1Q9BQI6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLF1Q9BQI6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SLF1Q9BQI6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLF1Q9BQI6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLF1Q9BQI6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SLF1Q9BQI6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SLF1Q9BQI6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SLF1Q9BQI6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLF1Q9BQI6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SLF1Q9BQI6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SLF1Q9BQI6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLF1Q9BQI6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLF1Q9BQI6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLF1Q9BQI6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLF1Q9BQI6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLF1Q9BQI6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SLF1Q9BQI6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLF1Q9BQI6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLF1Q9BQI6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLF1Q9BQI6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLF1Q9BQI6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLF1Q9BQI6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLF1Q9BQI6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLF1Q9BQI6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLF1Q9BQI6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLF1Q9BQI6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLF1Q9BQI6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLF1Q9BQI6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLF1Q9BQI6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLF1Q9BQI6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLF1Q9BQI6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLF1Q9BQI6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLF1Q9BQI6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SLF1Q9BQI6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLF1Q9BQI6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLF1Q9BQI6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLF1Q9BQI6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLF1Q9BQI6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLF1Q9BQI6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLF1Q9BQI6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLF1Q9BQI6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
SLF1Q9BQI6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SLF1Q9BQI6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLF1Q9BQI6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLF1Q9BQI6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SLF1Q9BQI6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SLF1Q9BQI6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SLF1Q9BQI6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLF1Q9BQI6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SLF1Q9BQI6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLF1Q9BQI6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLF1Q9BQI6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLF1Q9BQI6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLF1Q9BQI6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SLF1Q9BQI6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLF1Q9BQI6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SLF1Q9BQI6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLF1Q9BQI6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
SLF1Q9BQI6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SLF1Q9BQI6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SLF1Q9BQI6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLF1Q9BQI6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SLF1Q9BQI6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SLF1Q9BQI6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SLF1Q9BQI6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SLF1Q9BQI6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SLF1Q9BQI6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SLF1Q9BQI6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLF1Q9BQI6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLF1Q9BQI6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLF1Q9BQI6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLF1Q9BQI6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SLF1Q9BQI6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SLF1Q9BQI6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SLF1Q9BQI6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLF1Q9BQI6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLF1Q9BQI6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms