Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RETNLBQ9BQ08 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RETNLBQ9BQ08 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RETNLBQ9BQ08 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RETNLBQ9BQ08 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RETNLBQ9BQ08 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
RETNLBQ9BQ08 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RETNLBQ9BQ08 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RETNLBQ9BQ08 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RETNLBQ9BQ08 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RETNLBQ9BQ08 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RETNLBQ9BQ08 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RETNLBQ9BQ08 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RETNLBQ9BQ08 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RETNLBQ9BQ08 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RETNLBQ9BQ08 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RETNLBQ9BQ08 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RETNLBQ9BQ08 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RETNLBQ9BQ08 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RETNLBQ9BQ08 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RETNLBQ9BQ08 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RETNLBQ9BQ08 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RETNLBQ9BQ08 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RETNLBQ9BQ08 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RETNLBQ9BQ08 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RETNLBQ9BQ08 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RETNLBQ9BQ08 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
RETNLBQ9BQ08 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RETNLBQ9BQ08 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RETNLBQ9BQ08 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RETNLBQ9BQ08 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RETNLBQ9BQ08 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RETNLBQ9BQ08 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RETNLBQ9BQ08 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RETNLBQ9BQ08 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RETNLBQ9BQ08 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RETNLBQ9BQ08 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RETNLBQ9BQ08 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RETNLBQ9BQ08 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RETNLBQ9BQ08 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RETNLBQ9BQ08 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
RETNLBQ9BQ08 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
RETNLBQ9BQ08 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
RETNLBQ9BQ08 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RETNLBQ9BQ08 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RETNLBQ9BQ08 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RETNLBQ9BQ08 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RETNLBQ9BQ08 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RETNLBQ9BQ08 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RETNLBQ9BQ08 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RETNLBQ9BQ08 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RETNLBQ9BQ08 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RETNLBQ9BQ08 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RETNLBQ9BQ08 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RETNLBQ9BQ08 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RETNLBQ9BQ08 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RETNLBQ9BQ08 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RETNLBQ9BQ08 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RETNLBQ9BQ08 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RETNLBQ9BQ08 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RETNLBQ9BQ08 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RETNLBQ9BQ08 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RETNLBQ9BQ08 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RETNLBQ9BQ08 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RETNLBQ9BQ08 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RETNLBQ9BQ08 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RETNLBQ9BQ08 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RETNLBQ9BQ08 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RETNLBQ9BQ08 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RETNLBQ9BQ08 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RETNLBQ9BQ08 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RETNLBQ9BQ08 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RETNLBQ9BQ08 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RETNLBQ9BQ08 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RETNLBQ9BQ08 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RETNLBQ9BQ08 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RETNLBQ9BQ08 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RETNLBQ9BQ08 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
RETNLBQ9BQ08 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
RETNLBQ9BQ08 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RETNLBQ9BQ08 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RETNLBQ9BQ08 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RETNLBQ9BQ08 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RETNLBQ9BQ08 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RETNLBQ9BQ08 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RETNLBQ9BQ08 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
RETNLBQ9BQ08 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RETNLBQ9BQ08 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RETNLBQ9BQ08 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RETNLBQ9BQ08 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
RETNLBQ9BQ08 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RETNLBQ9BQ08 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RETNLBQ9BQ08 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RETNLBQ9BQ08 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RETNLBQ9BQ08 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RETNLBQ9BQ08 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RETNLBQ9BQ08 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
RETNLBQ9BQ08 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RETNLBQ9BQ08 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
RETNLBQ9BQ08 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.6 ms