Protein–RNA interactions for Protein: Q99612

KLF6, Krueppel-like factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF6Q99612 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLF6Q99612 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLF6Q99612 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLF6Q99612 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLF6Q99612 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLF6Q99612 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLF6Q99612 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLF6Q99612 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLF6Q99612 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLF6Q99612 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLF6Q99612 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLF6Q99612 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLF6Q99612 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLF6Q99612 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLF6Q99612 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLF6Q99612 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLF6Q99612 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLF6Q99612 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLF6Q99612 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLF6Q99612 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLF6Q99612 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLF6Q99612 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLF6Q99612 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLF6Q99612 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLF6Q99612 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLF6Q99612 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLF6Q99612 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLF6Q99612 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLF6Q99612 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLF6Q99612 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLF6Q99612 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLF6Q99612 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLF6Q99612 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLF6Q99612 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLF6Q99612 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLF6Q99612 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLF6Q99612 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLF6Q99612 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLF6Q99612 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLF6Q99612 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLF6Q99612 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLF6Q99612 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLF6Q99612 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLF6Q99612 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLF6Q99612 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLF6Q99612 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
KLF6Q99612 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLF6Q99612 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLF6Q99612 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLF6Q99612 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
KLF6Q99612 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
KLF6Q99612 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLF6Q99612 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
KLF6Q99612 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLF6Q99612 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLF6Q99612 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
KLF6Q99612 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLF6Q99612 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLF6Q99612 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLF6Q99612 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLF6Q99612 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLF6Q99612 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLF6Q99612 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLF6Q99612 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLF6Q99612 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLF6Q99612 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLF6Q99612 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLF6Q99612 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLF6Q99612 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLF6Q99612 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLF6Q99612 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLF6Q99612 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KLF6Q99612 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLF6Q99612 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLF6Q99612 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLF6Q99612 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
KLF6Q99612 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLF6Q99612 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLF6Q99612 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLF6Q99612 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLF6Q99612 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLF6Q99612 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLF6Q99612 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLF6Q99612 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLF6Q99612 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLF6Q99612 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLF6Q99612 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLF6Q99612 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLF6Q99612 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLF6Q99612 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLF6Q99612 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLF6Q99612 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLF6Q99612 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLF6Q99612 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLF6Q99612 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLF6Q99612 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLF6Q99612 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLF6Q99612 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLF6Q99612 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KLF6Q99612 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.5 ms